24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2084 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  829    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  67.91 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  50.94 
 
 		 427 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  50.94 
 
 		 427 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  48.6 
 
 		 426 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  52.2 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  49.41 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  36.61 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  28.14 
 
 		 432 aa  96.3  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  31.94 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  26.37 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  41.51 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  28.12 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  25.85 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  30.08 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  30.33 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>