40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0998 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  815    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  44.52 
 
 
432 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  40.21 
 
 
426 aa  186  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  29.89 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  36.67 
 
 
438 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  36.67 
 
 
456 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  36.22 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  36.41 
 
 
466 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  36.41 
 
 
466 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  36.41 
 
 
466 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  36.22 
 
 
466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  37.53 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  29.66 
 
 
436 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  34.7 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  34.7 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  30.63 
 
 
426 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  34.43 
 
 
406 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  31.33 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  34.15 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  24.86 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  25.45 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  34.8 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  29.87 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  30.6 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  25.13 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  25.25 
 
 
428 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  22.64 
 
 
410 aa  63.5  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  25.93 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  27.78 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  27.76 
 
 
396 aa  53.5  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1536  hypothetical protein  28.41 
 
 
427 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  28.13 
 
 
434 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  28.13 
 
 
452 aa  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2359  hypothetical protein  27.14 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  29.38 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  32.09 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  28.43 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  28.43 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1299  hypothetical protein  27 
 
 
420 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>