More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2861 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  60.45 
 
 
198 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  50.86 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  50.86 
 
 
197 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  50.86 
 
 
197 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  44.62 
 
 
198 aa  184  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  48.98 
 
 
202 aa  175  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  42.86 
 
 
198 aa  175  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  40.91 
 
 
199 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  41.05 
 
 
202 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  42.61 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  41.44 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  41.44 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  37.88 
 
 
199 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  40.88 
 
 
199 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  39.79 
 
 
199 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  40.93 
 
 
202 aa  141  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  40.1 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  38.67 
 
 
199 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  37.29 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  37.7 
 
 
202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  38.22 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  41.01 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  40.1 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  38.86 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  37.82 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  37.65 
 
 
212 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  35.86 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  36.92 
 
 
204 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  35.56 
 
 
202 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  36.81 
 
 
182 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  33.16 
 
 
200 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  32.62 
 
 
200 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  34.86 
 
 
202 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  38.34 
 
 
199 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  36 
 
 
202 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  33.16 
 
 
193 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  37.43 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  38.35 
 
 
211 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  37.5 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  34.95 
 
 
204 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  34.95 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  32.99 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  38.67 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  32.09 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  32.12 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  36.16 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  31.96 
 
 
219 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  34.34 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  33.85 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0693  maf protein  34.62 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  30.69 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  31.91 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  28.21 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  38.33 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1674  Maf-like protein  32.98 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  30.96 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3504  maf protein  34.31 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.65 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4776  Maf-like protein  33.82 
 
 
209 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.714834  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  29.44 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0846  maf protein  31.68 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  29.9 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7197  Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation-like protein  37.37 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  29.9 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  29.9 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  29.9 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  29.9 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3574  Maf-like protein  30.69 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  30.16 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0836  Maf-like protein  31.63 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679365  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  32.31 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  29.74 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  30.15 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0163  Maf-like protein  30.69 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2532  Maf-like protein  30.69 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  31.19 
 
 
207 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  33.68 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  33.01 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  30.39 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  30.69 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  30.39 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  31.09 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  30.46 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  30.48 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  31.19 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  28.72 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  30.48 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  33.68 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  31.05 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  32.98 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  29.63 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  29.41 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  33.51 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  29.44 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  28.88 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  31.58 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  29.74 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  29.95 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  36.27 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>