More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0295 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0295  maf protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  76.24 
 
 		 202 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  73.27 
 
 		 202 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  74.63 
 
 		 202 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  62.87 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  65.35 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  63.19 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  54.73 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  52.79 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  49.47 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  50.51 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  49.74 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  54.73 
 
 		 205 aa  174  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  50 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  51.55 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  51.55 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  54.05 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  54.05 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  46.67 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  44.44 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  44.62 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  42.02 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  50.25 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  50.55 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  48.86 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  42.93 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  47.75 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  42.11 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  36.08 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  41.36 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  49.75 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  51.38 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  49.74 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  37.7 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  40.51 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  45.41 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  40.91 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  40.91 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  40.34 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  42.22 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  38.76 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  38.69 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  35.64 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  35.64 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  35.64 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  34.74 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  35.64 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  35.64 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  34.18 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  39.2 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  35.11 
 
 		 191 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  34.57 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  34.38 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  37.77 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  33.51 
 
 		 191 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  37.17 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  33.33 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  34.55 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  37.17 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  34.9 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  39.89 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  33.33 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  37.57 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  30.93 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  31.55 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  34.74 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  34.72 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  34.54 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  34.57 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  36.6 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  37.57 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  42.11 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2602  maf protein  36.56 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  35.23 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  32.98 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  36.98 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  36.22 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3341  maf protein  34 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  39.56 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  35.94 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  34.54 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  34.03 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  34.27 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  34.27 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  34.85 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  37.13 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  31.91 
 
 		 191 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1119  maf protein  33.33 
 
 		 223 aa  94.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117235  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  32.11 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  31.77 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  34.74 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  34.18 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  35.6 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  33.51 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  36.65 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  33.85 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  32.79 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  36.32 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  34.39 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>