More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2670 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  94.42 
 
 
197 aa  342  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  93.4 
 
 
197 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  52.33 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  51.03 
 
 
198 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  53.14 
 
 
198 aa  191  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  49.73 
 
 
202 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  44.67 
 
 
198 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  45.51 
 
 
199 aa  161  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  44.69 
 
 
199 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  44.69 
 
 
199 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  49.49 
 
 
197 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  45.6 
 
 
199 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  43.85 
 
 
199 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  42.25 
 
 
202 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  43.98 
 
 
202 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  42.78 
 
 
199 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  41.75 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  42.78 
 
 
202 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  44 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  41.01 
 
 
199 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  46.67 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  44.16 
 
 
212 aa  124  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  45.45 
 
 
204 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  44.5 
 
 
204 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  36.16 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  42.13 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  42.27 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  35.53 
 
 
195 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  38.86 
 
 
202 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  39.11 
 
 
202 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  32.99 
 
 
193 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  45.51 
 
 
203 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  40.51 
 
 
205 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  41.54 
 
 
202 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  36.21 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  36.75 
 
 
182 aa  97.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  39.11 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  46.67 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  27.81 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  27.81 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  35.59 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  36.41 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  31.98 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  31.98 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  31.98 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  31.98 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  31.98 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.44 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  28.95 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  28.42 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  28.42 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  28.42 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  28.42 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  28.42 
 
 
191 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  36.07 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  44.69 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  30 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  27.37 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  26.84 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  38.06 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  28.42 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  29.26 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  33.16 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  29.32 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  30.26 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1468  maf protein  32.78 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  30.46 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  30.77 
 
 
207 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  28.72 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  30.46 
 
 
207 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  32.82 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  30.46 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  30.46 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  30.46 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  30.26 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  30.46 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  28.72 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  30.46 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  30.46 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  30.46 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1120  septum formation protein MaF  28.22 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.500254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  32.79 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  30.77 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  29.79 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  29.67 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  31.34 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  35.11 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  29.15 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  31.58 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  35.38 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  30.26 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  30.1 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  29.9 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  27.84 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  31.69 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  32.12 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  28.42 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  30.77 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  32.84 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>