More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4346 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  96.62 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  92.27 
 
 		 207 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  91.26 
 
 		 207 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  87.8 
 
 		 209 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  87.86 
 
 		 207 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  84.47 
 
 		 207 aa  364  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  70.1 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  70.1 
 
 		 215 aa  294  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  68.66 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  68.66 
 
 		 223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  68.5 
 
 		 229 aa  284  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  66.16 
 
 		 209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  66.67 
 
 		 228 aa  277  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  68.69 
 
 		 217 aa  277  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  63.55 
 
 		 208 aa  274  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  64.85 
 
 		 215 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  65.66 
 
 		 208 aa  270  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  67.32 
 
 		 206 aa  270  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  65.5 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  65.15 
 
 		 208 aa  268  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  63.05 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  64.65 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  64.14 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  59.09 
 
 		 208 aa  227  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  58.38 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  56.35 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  56.54 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  53.44 
 
 		 198 aa  195  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  49.29 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  49.74 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  54.45 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  54.08 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  47.15 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  49.22 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  53.01 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  52.08 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  51.04 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  48.69 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  50.25 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  50.26 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  48.39 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  48.92 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  46.52 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  48.24 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  45.16 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  48.7 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  44.95 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  46.94 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  48.02 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  44.44 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  45.64 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  45.03 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  45.03 
 
 		 195 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  44.67 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  48.3 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  44.83 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  43.15 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  44.29 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.97 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  46.15 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  45.41 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  46.5 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  42.19 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  45.64 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  46.5 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  45.92 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42.5 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  46.5 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  41.67 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  45.81 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  43.37 
 
 		 196 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  43.23 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  46.35 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  42.78 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  42.21 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  43.78 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  44.62 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  44.33 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  44.04 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  43.07 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  42.21 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  42.41 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  42.27 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  41.92 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  46.32 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  43.55 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  44.62 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  44.62 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  44.62 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  45.26 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  45.16 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  41.4 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  44.62 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  41.05 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  44.62 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  43.08 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  44.09 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  40.91 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  43.68 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>