More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0638 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  70.39 
 
 		 221 aa  301  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  69.9 
 
 		 206 aa  296  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  69.9 
 
 		 206 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  62.62 
 
 		 209 aa  267  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  62.07 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  63.55 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  62.56 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  63.05 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  63.59 
 
 		 208 aa  264  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  64.04 
 
 		 207 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  63.11 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  61.58 
 
 		 207 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  61.17 
 
 		 208 aa  260  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  64.14 
 
 		 215 aa  258  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  61.58 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  61.62 
 
 		 215 aa  250  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  59.09 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  61.69 
 
 		 228 aa  244  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  58.54 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  58.88 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  58.88 
 
 		 229 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  58.88 
 
 		 223 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  60.1 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  56.16 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  54.4 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  55.61 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  52.11 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  51.58 
 
 		 188 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  45.54 
 
 		 220 aa  177  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  52 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  47.06 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  47.09 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  47.42 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  49.74 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  45.16 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  49.74 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  47.45 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  47.76 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  49.73 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  45.79 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  49.21 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.6 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  39.9 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  45.18 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  43.5 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  44.04 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  48.13 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  46.35 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  46.35 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  43.88 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  46.35 
 
 		 194 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  43 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  46.94 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  43.15 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  43 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  43.55 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  41.45 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  46.63 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  45.31 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  45.2 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  46.46 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  42.41 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  42.08 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  43.75 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  43 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  42.49 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  43 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  43 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  45.79 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  43.32 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  43 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  46.02 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  44.33 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  41.15 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  42.13 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  42.13 
 
 		 194 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  43.92 
 
 		 193 aa  131  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  45.26 
 
 		 194 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  40.41 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  45.26 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  42.13 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  42.25 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  40.62 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  43.28 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  43.85 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  40.86 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  42.11 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  47.56 
 
 		 171 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  41 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  41.41 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  41.58 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  42.78 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  44.79 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  45.6 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  42.86 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  44.62 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  39.69 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  41 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  39.8 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>