More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4111 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4111  maf protein  100 
 
 
213 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  60.96 
 
 
210 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  64.52 
 
 
201 aa  211  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  57.29 
 
 
215 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  61.08 
 
 
199 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  62.37 
 
 
188 aa  201  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  55.9 
 
 
228 aa  201  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  56.61 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  53.61 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  55.45 
 
 
215 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  52.36 
 
 
207 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  51.04 
 
 
209 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  58.06 
 
 
190 aa  191  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  51.56 
 
 
207 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  53.61 
 
 
208 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  51.56 
 
 
207 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  51.04 
 
 
207 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  52.94 
 
 
208 aa  188  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  49.73 
 
 
198 aa  188  5.999999999999999e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  53.09 
 
 
208 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  53.48 
 
 
207 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  54.89 
 
 
201 aa  185  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  52.08 
 
 
207 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  54.12 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  52.26 
 
 
208 aa  181  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  54.97 
 
 
215 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  56.45 
 
 
212 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  53.81 
 
 
217 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  51.83 
 
 
229 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  51.83 
 
 
223 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  51.83 
 
 
223 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  48.97 
 
 
221 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  45.86 
 
 
192 aa  174  8e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  50 
 
 
206 aa  174  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  43.96 
 
 
192 aa  171  7.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  43.46 
 
 
209 aa  166  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  50 
 
 
190 aa  165  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  47.4 
 
 
206 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  47.4 
 
 
206 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  49.73 
 
 
193 aa  158  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  49.73 
 
 
194 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  44.12 
 
 
220 aa  152  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  52.02 
 
 
192 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  51.18 
 
 
192 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  47.54 
 
 
196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  45.79 
 
 
195 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  45.79 
 
 
195 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  51.46 
 
 
192 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  45.64 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  45.55 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  44.33 
 
 
194 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  45.5 
 
 
198 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  45.6 
 
 
194 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  45.13 
 
 
207 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  45.45 
 
 
199 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  45.6 
 
 
194 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  41.79 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  46.24 
 
 
200 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  47.62 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  44.5 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  45.08 
 
 
194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  45.18 
 
 
200 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  42.7 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  44 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  47.8 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  44 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  44.22 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  44.22 
 
 
200 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.32 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  40.8 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  44.44 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  39.18 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  43.5 
 
 
206 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  50 
 
 
196 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  44.44 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  42.13 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  44.95 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  46.52 
 
 
203 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  44.23 
 
 
207 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  43.52 
 
 
196 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  41.58 
 
 
194 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  45.13 
 
 
200 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  45.23 
 
 
203 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  45.1 
 
 
203 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  44.62 
 
 
200 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  44.74 
 
 
201 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  47.59 
 
 
202 aa  121  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  43.94 
 
 
198 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  44.44 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3913  maf protein  49.15 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.250688  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  43.08 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  42.08 
 
 
189 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  46.63 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  44.75 
 
 
193 aa  118  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  41.49 
 
 
210 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  46.24 
 
 
189 aa  118  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  41.09 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  43.39 
 
 
202 aa  118  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  40.21 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  42.02 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>