More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0378 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0378  maf protein  100 
 
 
202 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  52.72 
 
 
203 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  53.8 
 
 
201 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  52.75 
 
 
197 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  52.75 
 
 
197 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  52.75 
 
 
197 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  52.02 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  55.49 
 
 
193 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  52.36 
 
 
203 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  51.09 
 
 
197 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  52.72 
 
 
197 aa  174  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  51.37 
 
 
194 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  49.73 
 
 
197 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  49.73 
 
 
197 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  49.73 
 
 
197 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  52.72 
 
 
202 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  48.74 
 
 
201 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  52.41 
 
 
202 aa  168  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  49.73 
 
 
198 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  49.18 
 
 
197 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  55.68 
 
 
189 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  51.83 
 
 
203 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  52.66 
 
 
196 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  50 
 
 
197 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  48.63 
 
 
197 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  51.37 
 
 
200 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  51.28 
 
 
200 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  54.59 
 
 
199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  45.41 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  48.63 
 
 
197 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  48.44 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  49.2 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  43.48 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  47.09 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  45.13 
 
 
202 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  47.54 
 
 
197 aa  161  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  47.54 
 
 
197 aa  161  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  50.54 
 
 
196 aa  160  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  47.54 
 
 
197 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  43.48 
 
 
189 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  48.97 
 
 
202 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  47.54 
 
 
197 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  47.24 
 
 
200 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  47.74 
 
 
200 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  47.74 
 
 
200 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  46.99 
 
 
197 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  46.99 
 
 
197 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  46.99 
 
 
197 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  46.99 
 
 
197 aa  158  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  46.99 
 
 
197 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  47.24 
 
 
200 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  46.35 
 
 
196 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  45.83 
 
 
199 aa  158  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  47.74 
 
 
206 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  44.39 
 
 
191 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  47.74 
 
 
201 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  51.32 
 
 
194 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  51.32 
 
 
194 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  46.11 
 
 
194 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  46.63 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  44.21 
 
 
212 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  44.44 
 
 
198 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  50.79 
 
 
194 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  48.72 
 
 
200 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  45.08 
 
 
194 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  45.95 
 
 
195 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  45.08 
 
 
194 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  45.08 
 
 
194 aa  151  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  50.53 
 
 
205 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  46.15 
 
 
210 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  51.01 
 
 
204 aa  151  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  49.46 
 
 
195 aa  151  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  49.46 
 
 
195 aa  151  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  48.21 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  45.31 
 
 
198 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  45.45 
 
 
201 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  47.64 
 
 
200 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  47 
 
 
207 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  46 
 
 
202 aa  147  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  40.11 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  40.84 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  45.65 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  45.31 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  50.25 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  44.32 
 
 
191 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  44.32 
 
 
191 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  44.32 
 
 
191 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  44.67 
 
 
200 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  44.32 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  45.9 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  44.32 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  45.02 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  48.92 
 
 
213 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  48.96 
 
 
209 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  44.33 
 
 
202 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  48.96 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  48.47 
 
 
210 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  44.55 
 
 
208 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  46.73 
 
 
207 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  41.67 
 
 
198 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>