More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0470 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0470  maf protein  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  68.23 
 
 
198 aa  257  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  69.59 
 
 
196 aa  255  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  67.02 
 
 
198 aa  251  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  65.45 
 
 
195 aa  242  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  64.95 
 
 
194 aa  241  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  66.14 
 
 
194 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  65.8 
 
 
198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  65.61 
 
 
194 aa  234  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  64.55 
 
 
194 aa  232  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  64 
 
 
200 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  58.79 
 
 
205 aa  224  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  63.5 
 
 
200 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  61.62 
 
 
198 aa  223  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  63.5 
 
 
200 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  63.5 
 
 
200 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  56.54 
 
 
198 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  59.16 
 
 
197 aa  194  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  59.16 
 
 
197 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  54.69 
 
 
200 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  59.16 
 
 
197 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  59.16 
 
 
197 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  59.16 
 
 
197 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  53.93 
 
 
191 aa  190  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  55.26 
 
 
194 aa  187  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  55.5 
 
 
197 aa  184  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  53.16 
 
 
201 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  56.25 
 
 
203 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  57.07 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  54.97 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  54.69 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  54.12 
 
 
197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  55.73 
 
 
196 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  54.45 
 
 
197 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  52.36 
 
 
189 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  54.69 
 
 
203 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  56.32 
 
 
197 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  56.25 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  54.45 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  52.08 
 
 
192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  54.45 
 
 
197 aa  178  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  54.45 
 
 
197 aa  178  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  54.45 
 
 
197 aa  178  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  54.45 
 
 
197 aa  178  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  54.45 
 
 
197 aa  178  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  55.56 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  55.56 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  55.56 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  53.89 
 
 
197 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  52.33 
 
 
201 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  54.01 
 
 
200 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  50.26 
 
 
189 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  54.21 
 
 
198 aa  175  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  49.23 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  54.5 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  50.26 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  45.96 
 
 
196 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  53.89 
 
 
201 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  53.48 
 
 
200 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  54.74 
 
 
197 aa  168  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  49.74 
 
 
192 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  56.02 
 
 
197 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  55.73 
 
 
202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  52.46 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  51.08 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  55.21 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  48.42 
 
 
192 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  51.91 
 
 
191 aa  160  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  46.77 
 
 
196 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  52.17 
 
 
209 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  45.6 
 
 
201 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4353  maf protein  48.72 
 
 
212 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000929678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  48.21 
 
 
202 aa  157  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  48.91 
 
 
193 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  52.79 
 
 
194 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  48.73 
 
 
228 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  47.85 
 
 
193 aa  154  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  48.73 
 
 
210 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  49.48 
 
 
210 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  50 
 
 
189 aa  154  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  46.84 
 
 
194 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  48.97 
 
 
199 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  52.28 
 
 
194 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  43.98 
 
 
191 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  48.72 
 
 
210 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  49.23 
 
 
209 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  43.98 
 
 
191 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  52.02 
 
 
194 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  49.47 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  48.91 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  48.72 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  48.72 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  49.23 
 
 
209 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  46.39 
 
 
202 aa  151  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  43.46 
 
 
203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  47.67 
 
 
207 aa  151  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  43.46 
 
 
191 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  43.46 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  42.93 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  48.68 
 
 
202 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>