More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2338 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  99.05 
 
 		 210 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  96.19 
 
 		 210 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  95.24 
 
 		 210 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  95.24 
 
 		 210 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  94.47 
 
 		 210 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  91.46 
 
 		 210 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1009  Maf-like protein  81.9 
 
 		 210 aa  307  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  75 
 
 		 209 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  75 
 
 		 209 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1890  Maf-like protein  80.95 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1234  Maf-like protein  80.95 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1378  Maf-like protein  80.95 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0798  Maf-like protein  80.95 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1225  Maf-like protein  80.95 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0352  Maf-like protein  80.95 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1069  Maf-like protein  80.95 
 
 		 209 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2070  Maf-like protein  75.85 
 
 		 208 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680146  normal  0.298282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  64.5 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  63.5 
 
 		 207 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  63.32 
 
 		 200 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  63.9 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  62.63 
 
 		 200 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  55.22 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  59.6 
 
 		 200 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  58.25 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  63.21 
 
 		 202 aa  197  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1343  Maf-like protein  61.03 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  56.57 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  57.79 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  58.71 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  55.56 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  58.71 
 
 		 208 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  54.87 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  58.79 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  58.08 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2689  maf protein  61.54 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  53 
 
 		 199 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  51.56 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  51.78 
 
 		 207 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  50 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  51.53 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  51.3 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  51.31 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  51.83 
 
 		 203 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  48.73 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  49.74 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  47.5 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  51.31 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  46.91 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  46.67 
 
 		 189 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  43.43 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  49.48 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  46.43 
 
 		 196 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  45.88 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  44.27 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  42.05 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  44.78 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  52.36 
 
 		 201 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  47.98 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  44.27 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  43.98 
 
 		 197 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  45.03 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  43.98 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  50.79 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  43.46 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  44.5 
 
 		 197 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  43.72 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  43.46 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  46.57 
 
 		 194 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  42.5 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  44.5 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  39.58 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  42.79 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  40.1 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  48.73 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  43.46 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  43.46 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  43.46 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  43.46 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  43.46 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  51.28 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42.65 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  51.03 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  38.68 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  47.64 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  49.21 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  46.6 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  47.45 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  45.59 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  42.27 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  43.46 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  43.98 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  43.98 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  45.69 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  43.98 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  46.23 
 
 		 205 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  38.02 
 
 		 199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  50.99 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  43.35 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>