More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2689 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2689  maf protein  100 
 
 		 201 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  71.57 
 
 		 200 aa  277  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  71.07 
 
 		 202 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  74.5 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  74.5 
 
 		 208 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  72.5 
 
 		 202 aa  268  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  65.83 
 
 		 200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  69.15 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  65.48 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  66.5 
 
 		 202 aa  232  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  64.14 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  64.14 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  64.25 
 
 		 200 aa  222  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1343  Maf-like protein  64.18 
 
 		 204 aa  218  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  57.64 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  64.65 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  63.08 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  62.56 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  55.12 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  63.32 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  61.54 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  61.54 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2070  Maf-like protein  62.05 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680146  normal  0.298282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  60.51 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  60.51 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  60.51 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  60.96 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  60.43 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1890  Maf-like protein  61.11 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0798  Maf-like protein  61.11 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1378  Maf-like protein  61.11 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.679584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1069  Maf-like protein  61.11 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1225  Maf-like protein  61.11 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1234  Maf-like protein  61.11 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0352  Maf-like protein  61.11 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1009  Maf-like protein  60.61 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  45.92 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  50.77 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  48.51 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  45.6 
 
 		 192 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  45.26 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  48.99 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  47.96 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  47.94 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  48.5 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  48.26 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  47.26 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  47.47 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  47.89 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  47.76 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  47.96 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  48.45 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  48.68 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  46.84 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  44.21 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  46.03 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  46.03 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  46.03 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  39.3 
 
 		 196 aa  144  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  45.5 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  46.91 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  41.5 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  45.5 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  45.5 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  45.5 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  45.5 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  45.5 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  47.98 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  39.27 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  47.45 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  46.39 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  46.39 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  44.39 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  47.45 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  45 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  55.56 
 
 		 171 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  42.71 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  44.9 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  44.97 
 
 		 197 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  44.97 
 
 		 197 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  44.97 
 
 		 197 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  44.44 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  42.33 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  44.44 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  42.42 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  46.46 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  45.64 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  45.96 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  46.97 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  44.27 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  43.81 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  47.45 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  45.45 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  46.88 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  43.08 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  37.11 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  41.54 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  43.08 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  42.05 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  41.8 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>