More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0943 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  91.58 
 
 		 203 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  92.57 
 
 		 203 aa  352  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  84.08 
 
 		 203 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  70.47 
 
 		 198 aa  266  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  71.13 
 
 		 200 aa  262  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  68.04 
 
 		 201 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  72.16 
 
 		 200 aa  248  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  69.59 
 
 		 201 aa  247  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  68.42 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  63.96 
 
 		 198 aa  231  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  58.7 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  56.02 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  56.15 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  54.59 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  53.3 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  54.26 
 
 		 192 aa  191  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  52.5 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  51.65 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  54.59 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  55.14 
 
 		 197 aa  188  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  54.59 
 
 		 197 aa  187  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  51.06 
 
 		 191 aa  186  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  54.05 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  53.76 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  53.76 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  53.76 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  53.76 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  54.69 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  53.76 
 
 		 197 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  55.68 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  52.69 
 
 		 192 aa  184  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  53.51 
 
 		 197 aa  184  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  52.04 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  55.68 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  55.68 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  55.68 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  55.68 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  55.73 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  52.43 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  54.05 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  52.43 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  52.43 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  52.43 
 
 		 194 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  53.89 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  48.89 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  50.26 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  52.45 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  48.42 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  48.5 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  52.13 
 
 		 193 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  52.97 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  51.83 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  53.51 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  52.72 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  52.38 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  50.52 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  52.43 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  53.51 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  49.74 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  46.94 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  52.31 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  49.74 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  51.79 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  51.79 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  47.47 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  44.15 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  51.28 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  48.4 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  48.4 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  50.25 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  52.43 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  51.61 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  49.73 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  51.35 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  44.79 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  44.79 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  49.49 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  49.73 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  44.79 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  50.81 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  52.97 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  48.99 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  44.27 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  48.99 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  44.79 
 
 		 191 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  44.79 
 
 		 191 aa  150  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  48.24 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  48.47 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  44.27 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  43.23 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  42.19 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  48.99 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  50 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  53.19 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  47.12 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  50.26 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  50.26 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  50.26 
 
 		 210 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  46.32 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>