More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0406 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0406  maf protein  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  69.5 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  70.98 
 
 		 198 aa  269  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  70.71 
 
 		 198 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  69.59 
 
 		 194 aa  255  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  65.97 
 
 		 198 aa  250  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  64.74 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  64.1 
 
 		 198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  64.74 
 
 		 194 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  64.74 
 
 		 194 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  64.74 
 
 		 194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  62.3 
 
 		 195 aa  237  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  61.5 
 
 		 200 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  61 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  60 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  60 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  58.76 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  58.76 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  58.76 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  58.25 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  57.73 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  57.73 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  57.22 
 
 		 197 aa  204  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  58.25 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  58.64 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  58.64 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  58.64 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  58.12 
 
 		 194 aa  201  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  56.7 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  56.19 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  56.19 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  56.19 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  56.19 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  56.19 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  55.67 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  55.26 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  56.7 
 
 		 197 aa  195  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  53.65 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  52.63 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  52.82 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  56.19 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  54.69 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  55.79 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  51.3 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  55.67 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  52.36 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  55.73 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  55.32 
 
 		 197 aa  180  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  53.65 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  53.37 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  52.97 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  54.97 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  50.53 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  54.21 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  52.41 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  53.68 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  52.63 
 
 		 194 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  44.56 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  49.47 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  55.56 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  53.65 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  45.92 
 
 		 196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  52.08 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  47.89 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  49.74 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  49.74 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  49.74 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  51.58 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  47.18 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  51.91 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  50 
 
 		 202 aa  160  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  53.44 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  47.15 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  53.51 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  48.98 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4353  maf protein  51.91 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000929678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  47.72 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  46.41 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  51.28 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  52.15 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  48.63 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  50.81 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  46.97 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  46.97 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  45.3 
 
 		 191 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  46.63 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  45.3 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  44.75 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  49.73 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  51.37 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  44.75 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  46.34 
 
 		 240 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  48.13 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  44.2 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  44.2 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  50.53 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  48.45 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  45.3 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  49.18 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  43.09 
 
 		 191 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>