More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3331 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3331  maf protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  68.56 
 
 
195 aa  275  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  67.02 
 
 
194 aa  251  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  65.97 
 
 
196 aa  250  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  65.8 
 
 
198 aa  246  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  63.49 
 
 
198 aa  244  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  62.43 
 
 
194 aa  236  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  62.43 
 
 
194 aa  235  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  63.08 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  63.08 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  61.9 
 
 
194 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  64.1 
 
 
200 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  64.1 
 
 
200 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  61.9 
 
 
194 aa  231  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  59.18 
 
 
205 aa  228  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  58.97 
 
 
198 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  58.73 
 
 
197 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  58.73 
 
 
197 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  58.73 
 
 
197 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  58.2 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  58.2 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  53.77 
 
 
197 aa  193  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  53.77 
 
 
197 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  53.27 
 
 
197 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  52.76 
 
 
197 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  53.97 
 
 
197 aa  191  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  52.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  52.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  52.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  52.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  52.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  52.6 
 
 
189 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  53.26 
 
 
198 aa  185  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  51.04 
 
 
189 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  52.63 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  55.68 
 
 
197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  50.26 
 
 
206 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  54.05 
 
 
198 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  52.08 
 
 
194 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  54.3 
 
 
197 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  52.38 
 
 
192 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  50.52 
 
 
197 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  50.52 
 
 
197 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  50.52 
 
 
197 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  53.44 
 
 
201 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  54.55 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  54.84 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  50.79 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  50.26 
 
 
192 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  52.15 
 
 
203 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  52.43 
 
 
203 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  51.09 
 
 
200 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  48.92 
 
 
192 aa  168  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  54.59 
 
 
205 aa  167  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  50 
 
 
207 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  49.48 
 
 
207 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  47.89 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  52.98 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  51.06 
 
 
196 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  48.17 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4353  maf protein  50.27 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000929678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  51.58 
 
 
199 aa  161  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  50 
 
 
194 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  47.89 
 
 
196 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  50 
 
 
194 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  51.89 
 
 
200 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  51.05 
 
 
189 aa  158  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  48.94 
 
 
202 aa  158  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  49.24 
 
 
199 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  51.35 
 
 
200 aa  158  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  49.73 
 
 
201 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  47.09 
 
 
240 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  48.19 
 
 
200 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  50.54 
 
 
199 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  45.99 
 
 
202 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  43.37 
 
 
201 aa  154  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  46.49 
 
 
194 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  50 
 
 
201 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  49.21 
 
 
198 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  50.81 
 
 
203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  45.27 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2257  maf protein  46.8 
 
 
271 aa  151  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  49.18 
 
 
192 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  50.81 
 
 
202 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  48.66 
 
 
193 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  44.92 
 
 
189 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  46.84 
 
 
207 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  44.79 
 
 
200 aa  148  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  43.09 
 
 
193 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  47.25 
 
 
197 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  47 
 
 
207 aa  147  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  47.06 
 
 
193 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  46.99 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  48.17 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  46.63 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  46.11 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  48.95 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  44.74 
 
 
207 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  44.62 
 
 
209 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>