More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3189 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  60 
 
 
197 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  60 
 
 
197 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  60 
 
 
197 aa  202  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  53.89 
 
 
198 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  53.65 
 
 
201 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  58.38 
 
 
197 aa  198  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  53.89 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  56.76 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  52.91 
 
 
191 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  57.84 
 
 
197 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  56.48 
 
 
201 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  57.3 
 
 
197 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  57.3 
 
 
197 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  56.76 
 
 
197 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  56.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  56.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  56.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  56.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  53.44 
 
 
202 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  56.76 
 
 
197 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  56.22 
 
 
197 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  53.61 
 
 
200 aa  188  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  52.33 
 
 
198 aa  187  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  56.22 
 
 
197 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  56.22 
 
 
197 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  56.22 
 
 
197 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  54.12 
 
 
196 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  55.68 
 
 
197 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  55.14 
 
 
197 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  54.87 
 
 
203 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  54.69 
 
 
194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  51.32 
 
 
189 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  55.14 
 
 
197 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  55.68 
 
 
197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  51.34 
 
 
201 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  54.69 
 
 
203 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  55.67 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  55.38 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  52.75 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  50.81 
 
 
189 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  52.06 
 
 
200 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  54.55 
 
 
205 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  49.01 
 
 
205 aa  174  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  47.34 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  50 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  50.79 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  53.85 
 
 
203 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  52.41 
 
 
196 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  48.47 
 
 
198 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  53.65 
 
 
202 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  48.96 
 
 
193 aa  168  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  48.17 
 
 
212 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  51.58 
 
 
194 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  50.51 
 
 
200 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  50.51 
 
 
200 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  50 
 
 
194 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  51.05 
 
 
200 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  50 
 
 
198 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  48.65 
 
 
196 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  44.5 
 
 
202 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  45.27 
 
 
206 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  50 
 
 
200 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  49.2 
 
 
195 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  50 
 
 
200 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  49.21 
 
 
202 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  42.86 
 
 
192 aa  155  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  46.74 
 
 
195 aa  151  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  46.74 
 
 
195 aa  151  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  47.62 
 
 
200 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  42.02 
 
 
196 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  44.92 
 
 
199 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  44.5 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  43.98 
 
 
201 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  43.41 
 
 
207 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  45.41 
 
 
207 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  43.16 
 
 
194 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  46.15 
 
 
202 aa  141  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  44.38 
 
 
186 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  42.44 
 
 
207 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  46.97 
 
 
194 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  46.07 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  44.72 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  45.03 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  45.77 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  49.39 
 
 
171 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  42.55 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  41.24 
 
 
192 aa  138  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  43.98 
 
 
210 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  43.98 
 
 
210 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  43.98 
 
 
210 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  45.96 
 
 
194 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  46.86 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  45.79 
 
 
207 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  44.16 
 
 
209 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  45.74 
 
 
199 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  44.16 
 
 
209 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  42.13 
 
 
208 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>