More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2217 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  100 
 
 
210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  99.05 
 
 
228 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  96.19 
 
 
210 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  95.24 
 
 
210 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  95.24 
 
 
210 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  93.47 
 
 
210 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  91.46 
 
 
210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1009  Maf-like protein  81.43 
 
 
210 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  75 
 
 
209 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  74.52 
 
 
209 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1890  Maf-like protein  80.48 
 
 
209 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1234  Maf-like protein  80.48 
 
 
209 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1378  Maf-like protein  80.48 
 
 
209 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1225  Maf-like protein  80.48 
 
 
209 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0798  Maf-like protein  80.48 
 
 
209 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1069  Maf-like protein  80.48 
 
 
209 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0352  Maf-like protein  80.48 
 
 
209 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2070  Maf-like protein  75.36 
 
 
208 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680146  normal  0.298282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  64 
 
 
207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  63 
 
 
207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  61.88 
 
 
200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  62.81 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  63.41 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  60.1 
 
 
200 aa  207  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  55.22 
 
 
208 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  58.25 
 
 
200 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  62.18 
 
 
202 aa  194  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1343  Maf-like protein  60.51 
 
 
204 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  55.84 
 
 
207 aa  191  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  57.29 
 
 
202 aa  191  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  55.56 
 
 
206 aa  188  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  57.71 
 
 
208 aa  187  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  54.87 
 
 
202 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  57.71 
 
 
208 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  58.08 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  58.29 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2689  maf protein  61.54 
 
 
201 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  52.5 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  51.78 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  51.56 
 
 
202 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  50 
 
 
196 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  52.04 
 
 
201 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  51.81 
 
 
203 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  51.83 
 
 
198 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  50.26 
 
 
201 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  52.36 
 
 
203 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  48 
 
 
201 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  48.73 
 
 
194 aa  154  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  51.83 
 
 
203 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  47.42 
 
 
199 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  47.18 
 
 
189 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  50 
 
 
200 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  43.43 
 
 
191 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  46.43 
 
 
196 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  45.88 
 
 
192 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  44.78 
 
 
202 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  52.88 
 
 
201 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  44.27 
 
 
192 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  48.48 
 
 
200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  42.05 
 
 
192 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  44.79 
 
 
198 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  43.98 
 
 
197 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  46.07 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  43.98 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  51.31 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  43.46 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  44.5 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  43.46 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  43.72 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  40.1 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  51.79 
 
 
200 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  46.57 
 
 
194 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  48.73 
 
 
194 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  43.46 
 
 
197 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  43.46 
 
 
197 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  43.46 
 
 
197 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  43.46 
 
 
197 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  43.46 
 
 
197 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  42.79 
 
 
197 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  42.5 
 
 
193 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  43.46 
 
 
197 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  39.06 
 
 
189 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  49.74 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  48.17 
 
 
198 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  39.23 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42.65 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  50.52 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  47.12 
 
 
198 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  46.73 
 
 
205 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  47.96 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  45.69 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  42.27 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  43.46 
 
 
197 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  44.61 
 
 
194 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  38.34 
 
 
199 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  43.98 
 
 
197 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  43.98 
 
 
197 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  43.98 
 
 
197 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  46.67 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  49.68 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>