More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2196 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  92.46 
 
 		 207 aa  362  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  91.96 
 
 		 207 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  72.82 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  73.98 
 
 		 200 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  66.67 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  66.18 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  63.9 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  63.41 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  63.68 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  63.68 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  63.68 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  64.14 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  65.26 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  62.63 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2070  Maf-like protein  62.86 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680146  normal  0.298282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1890  Maf-like protein  64.11 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1378  Maf-like protein  64.11 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1225  Maf-like protein  64.11 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1234  Maf-like protein  64.11 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0352  Maf-like protein  64.11 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1069  Maf-like protein  64.11 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0798  Maf-like protein  64.11 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  64 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  59.39 
 
 		 202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  57.71 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1009  Maf-like protein  63.59 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  64.1 
 
 		 202 aa  208  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  56.93 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  57.87 
 
 		 200 aa  207  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  60.4 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  61 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  60.8 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1343  Maf-like protein  62.18 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2689  maf protein  64.65 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  56.41 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  60.59 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  50.52 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  48.06 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  50.5 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  49.5 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  49.25 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  46.11 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  50.75 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  50.77 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  50.25 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  50.25 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  49.75 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  49.75 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  49.74 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  48.69 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  49.48 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  48.17 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  48.73 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  50 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  46.67 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  47.03 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  48.45 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  48.99 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  46.32 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  48.7 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  47.4 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  47.4 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  47.96 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  49.25 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  48.73 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  49.25 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  49.25 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  47.4 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  49.25 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01886  Maf-like protein  56.67 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  49 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  48.17 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  48.17 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  48.17 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  44.56 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  47.64 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  48.28 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0385886 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  46.88 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  46.88 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  46.88 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  46.88 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  46.88 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  45.77 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  48.24 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  47.12 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  47.45 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  46.35 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  44.79 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  49.25 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  47.45 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  40 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42.86 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  48 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  44.44 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  46.84 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  44.5 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  45.08 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  43.01 
 
 		 189 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  46.46 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>