More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0612 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  100 
 
 
208 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  75.24 
 
 
207 aa  311  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  55.39 
 
 
209 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  57.07 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  57.87 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  56.57 
 
 
207 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  56.22 
 
 
210 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  56.22 
 
 
210 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  56.22 
 
 
210 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  55.22 
 
 
210 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  54.41 
 
 
200 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  55.22 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2070  Maf-like protein  55.45 
 
 
208 aa  204  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680146  normal  0.298282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  55.29 
 
 
204 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  57.07 
 
 
210 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  56.02 
 
 
210 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  54.46 
 
 
202 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  54.63 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  57.71 
 
 
207 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1903  maf protein  53.66 
 
 
208 aa  198  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0936498  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1890  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0798  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1378  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0352  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  53.66 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1234  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1225  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1069  Maf-like protein  54.9 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  52.43 
 
 
200 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1009  Maf-like protein  53.92 
 
 
210 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  51.72 
 
 
200 aa  188  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1343  Maf-like protein  56.06 
 
 
204 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  52.24 
 
 
206 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2689  maf protein  57.64 
 
 
201 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  50.25 
 
 
201 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  57 
 
 
204 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  56.85 
 
 
202 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  49.51 
 
 
207 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  46.38 
 
 
197 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  46.38 
 
 
197 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  46.38 
 
 
197 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  45.89 
 
 
197 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  46.43 
 
 
199 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  45.41 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  47.21 
 
 
197 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  47 
 
 
200 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  47.21 
 
 
197 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  45.27 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  49.23 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  45.92 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  46.7 
 
 
197 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  46.7 
 
 
197 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  46.7 
 
 
197 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  46.7 
 
 
197 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  46.7 
 
 
197 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  46.7 
 
 
197 aa  151  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  46.7 
 
 
197 aa  151  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  46.7 
 
 
197 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  46.23 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  44.44 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  48.72 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  44.55 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  44.55 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.23 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  45.73 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  45.96 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  45.23 
 
 
194 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  45 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  43.9 
 
 
196 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  43.56 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  43.07 
 
 
191 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  43.94 
 
 
193 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  44.5 
 
 
194 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  43.72 
 
 
197 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  44 
 
 
194 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  45.77 
 
 
205 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  44 
 
 
194 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  46.94 
 
 
195 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  44.06 
 
 
197 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  44.06 
 
 
202 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  43.94 
 
 
192 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  44.28 
 
 
200 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  44.16 
 
 
198 aa  141  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  47.69 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  43.88 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  44.16 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  45.92 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  45.64 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  44.28 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  44.5 
 
 
200 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  44.5 
 
 
200 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  42.93 
 
 
202 aa  136  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  42.93 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  43.59 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  43.28 
 
 
197 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  43.28 
 
 
197 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  43.28 
 
 
197 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  42.05 
 
 
207 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  45.18 
 
 
203 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>