More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3556 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  76.56 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  76.04 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  76.04 
 
 		 192 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  66.14 
 
 		 190 aa  255  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  58.79 
 
 		 194 aa  214  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  57.38 
 
 		 213 aa  214  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  50.53 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  47.45 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  49.22 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  48.19 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  53.51 
 
 		 210 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  49.22 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  48.47 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  46.11 
 
 		 209 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  49.74 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  47.96 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  51.34 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  48.19 
 
 		 207 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  45.13 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  47.67 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  50 
 
 		 188 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  49.21 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  47.42 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  51.85 
 
 		 194 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  50 
 
 		 215 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  47.42 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  46.32 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  51.85 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  47.67 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  48.92 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  47.67 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  48.19 
 
 		 223 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  48.19 
 
 		 223 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  50.26 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  47.42 
 
 		 228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  48.92 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  47.15 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  49.46 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  48.65 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  45.79 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  47.42 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  42.22 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  46.91 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  44.75 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  44.79 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  45.5 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  45.5 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  44.79 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  44.27 
 
 		 194 aa  147  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  47.94 
 
 		 205 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  40.19 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  44.27 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  45.36 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  44.62 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  45.9 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  46.41 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  43.39 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  45.36 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  43.75 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  46.2 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  43.75 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  49.72 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  45.86 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  44.57 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  45.86 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  45.03 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  42.64 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  46.41 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  46.07 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  46.07 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  46.07 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  43.88 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  46.07 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  45.86 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  45.86 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  45.86 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  46.6 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  45.86 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  45.86 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42.27 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1947  maf protein  47.18 
 
 		 202 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  46.27 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  47.03 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  43.46 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  45.21 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  42.25 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  44.74 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  43.07 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  43.07 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  45.41 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  43.46 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  42.08 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  42.08 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  42 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  45.51 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  42.57 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  44.2 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  40.44 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  44.2 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>