More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0900 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  87.8 
 
 
207 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  88.29 
 
 
207 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  88.29 
 
 
207 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  86.34 
 
 
207 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  85.85 
 
 
207 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  84.88 
 
 
207 aa  361  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  70.5 
 
 
215 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  69 
 
 
215 aa  286  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  68.81 
 
 
228 aa  282  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  67 
 
 
229 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  66.17 
 
 
223 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  66.5 
 
 
223 aa  278  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  65.15 
 
 
209 aa  275  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  63.24 
 
 
215 aa  267  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  66.83 
 
 
206 aa  267  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  64.65 
 
 
217 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  62.07 
 
 
208 aa  264  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  63.5 
 
 
221 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  64.65 
 
 
208 aa  262  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  64.14 
 
 
208 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  61.58 
 
 
206 aa  255  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  63.64 
 
 
206 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  63.13 
 
 
206 aa  248  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  58.88 
 
 
199 aa  224  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  59.09 
 
 
208 aa  222  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  55.15 
 
 
201 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  54.45 
 
 
210 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  49.21 
 
 
198 aa  185  3e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  48.82 
 
 
220 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  53.4 
 
 
188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  48.98 
 
 
201 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  46.11 
 
 
193 aa  174  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  45.6 
 
 
192 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  51.37 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  52.13 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  45.83 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  50.52 
 
 
194 aa  165  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  48.74 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  44.85 
 
 
190 aa  160  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  46.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  47.18 
 
 
190 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  47.59 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  46.24 
 
 
192 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  47.24 
 
 
198 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  48.19 
 
 
192 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  47.94 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  44.92 
 
 
192 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  44.27 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  44.27 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  44.02 
 
 
207 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  43.15 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  47.67 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  45.64 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  45.92 
 
 
200 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42.5 
 
 
205 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.19 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  44.16 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  43.94 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  43.88 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  43.35 
 
 
206 aa  131  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  46.35 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  43.01 
 
 
200 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  41.67 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  44.62 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  43.43 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  41.92 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  43.65 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  42.78 
 
 
191 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  43.63 
 
 
200 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  46.03 
 
 
196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  43.63 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  43.37 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  42.63 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  41.36 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  44.1 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  43.15 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  43.14 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  43.14 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  44.92 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  44.33 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  42.78 
 
 
201 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  42.49 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  40.1 
 
 
207 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  45.03 
 
 
203 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  42.29 
 
 
198 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  44.27 
 
 
203 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  41.27 
 
 
202 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  43.16 
 
 
195 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  40.1 
 
 
207 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  40.32 
 
 
189 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  41.05 
 
 
198 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  43.23 
 
 
196 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  40.72 
 
 
199 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  41.09 
 
 
202 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  39.78 
 
 
189 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  40.1 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1243  maf protein  42.35 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.685882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  43.3 
 
 
194 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  43.01 
 
 
197 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>