More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0212 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  76.7 
 
 
206 aa  316  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  76.7 
 
 
206 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  70.39 
 
 
206 aa  301  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  63.11 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  65 
 
 
207 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  62.62 
 
 
208 aa  270  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  66.5 
 
 
207 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  63.11 
 
 
209 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  65.5 
 
 
207 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  66 
 
 
207 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  61.17 
 
 
208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  63.41 
 
 
207 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  64.5 
 
 
207 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  63.5 
 
 
209 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  58.02 
 
 
215 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  61.11 
 
 
215 aa  247  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  59.6 
 
 
215 aa  245  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  63 
 
 
206 aa  245  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  60 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  55.5 
 
 
229 aa  236  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  58.33 
 
 
217 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  55.5 
 
 
223 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  55.5 
 
 
223 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  54.97 
 
 
201 aa  208  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  54.73 
 
 
208 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  53.81 
 
 
199 aa  195  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  46.45 
 
 
220 aa  184  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  52.36 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  50 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  51.31 
 
 
188 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  51.76 
 
 
201 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  47.62 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  52.36 
 
 
194 aa  171  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  45.45 
 
 
192 aa  168  7e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  47.42 
 
 
193 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  47.94 
 
 
190 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  49.46 
 
 
213 aa  161  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  43.85 
 
 
192 aa  159  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  49.46 
 
 
190 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  47.89 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  44.62 
 
 
209 aa  151  8.999999999999999e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  45.96 
 
 
212 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  44 
 
 
212 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  48.17 
 
 
194 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  48.39 
 
 
201 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  41 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  45.18 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  44.16 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  45.16 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  45.08 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  45.08 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  45.27 
 
 
200 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  44.68 
 
 
198 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  45.69 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  45.69 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  43 
 
 
198 aa  138  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  45.27 
 
 
200 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  46.63 
 
 
192 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  46.33 
 
 
192 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  43.23 
 
 
189 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  43.59 
 
 
194 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  43.98 
 
 
198 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  45.79 
 
 
194 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  41.88 
 
 
196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  41.84 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  41.15 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  42.63 
 
 
191 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  42.47 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  43.32 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  46.02 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  44.1 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  44.09 
 
 
197 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  43.59 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  41.84 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  44.09 
 
 
197 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  44.09 
 
 
197 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  44.09 
 
 
197 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  44.09 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  40.86 
 
 
192 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  45.7 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  42.41 
 
 
196 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  43.39 
 
 
193 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  41.8 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  43.65 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  42.93 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  41.88 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  41.88 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  42 
 
 
197 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  42 
 
 
197 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  43.15 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  38.95 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  42.25 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  42 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  43.39 
 
 
193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  42 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  45.16 
 
 
203 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  41.5 
 
 
197 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  41.5 
 
 
197 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  43.08 
 
 
205 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>