More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4276 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  96.62 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  92.27 
 
 		 207 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  93.2 
 
 		 207 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  86.34 
 
 		 209 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  87.38 
 
 		 207 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  84.47 
 
 		 207 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  71.08 
 
 		 215 aa  297  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  68.63 
 
 		 215 aa  292  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  69.65 
 
 		 223 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  69.65 
 
 		 223 aa  289  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  69.5 
 
 		 229 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  66.67 
 
 		 209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  66.67 
 
 		 228 aa  277  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  67.68 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  65.84 
 
 		 215 aa  274  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  63.05 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  66.16 
 
 		 208 aa  271  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  66.5 
 
 		 221 aa  270  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  66.34 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  65.66 
 
 		 208 aa  268  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  63.55 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  66.16 
 
 		 206 aa  257  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  65.66 
 
 		 206 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  57.58 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  58.38 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  55.84 
 
 		 201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  55.5 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  52.38 
 
 		 198 aa  194  9e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  47.87 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  48.19 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  52.88 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  51.02 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  46.11 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  49.22 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  51.3 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  52.46 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  50.25 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  47.42 
 
 		 190 aa  168  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  50 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  49.74 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  46.77 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  45.99 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  49.17 
 
 		 198 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  48.24 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  45.96 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  45.45 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  45.69 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  45.7 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  48.7 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  46.19 
 
 		 194 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  47.46 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  44.27 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  44.27 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  42.71 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  45.41 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  44.1 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  42.64 
 
 		 200 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  48.3 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.46 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  43.33 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  43.84 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  44.9 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  43.88 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  45.18 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  44.9 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  41.45 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  45.77 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  45.77 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  45.77 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  45.1 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  41.97 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  45.83 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  42 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  43.78 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  41.09 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  42.27 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  43.81 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  42.25 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  41.58 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  41.09 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  44.1 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  44.21 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  43.01 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  40.91 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  41.36 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  43.01 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  45.26 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  43.55 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  43.55 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  43.55 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  40.53 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  44.09 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  44.5 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  43.43 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  41.4 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  44.09 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  44.09 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  43.01 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  41.4 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>