More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0600 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  100 
 
 
192 aa  374  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  95.31 
 
 
192 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  95.83 
 
 
192 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  76.04 
 
 
193 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  64.21 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  61.96 
 
 
194 aa  217  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  59.56 
 
 
213 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  56.38 
 
 
199 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  55.91 
 
 
190 aa  184  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  59.24 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  56.42 
 
 
188 aa  177  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  55.08 
 
 
208 aa  175  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  53.76 
 
 
212 aa  174  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  49.23 
 
 
208 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  48.21 
 
 
208 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  47.94 
 
 
209 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  49.48 
 
 
207 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  50.78 
 
 
215 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  51.79 
 
 
228 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  48.45 
 
 
207 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  51.3 
 
 
229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  53.8 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  46.67 
 
 
221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  48.72 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  48.45 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  50.78 
 
 
223 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  50.5 
 
 
215 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  46.15 
 
 
207 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  49.74 
 
 
209 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  53.16 
 
 
194 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  50.78 
 
 
223 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  48.19 
 
 
194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  46.99 
 
 
198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  47.94 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  47.94 
 
 
207 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  49.47 
 
 
206 aa  161  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  52.11 
 
 
194 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  45.88 
 
 
206 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  52.55 
 
 
217 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  52.63 
 
 
194 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  46.63 
 
 
194 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  46.63 
 
 
194 aa  158  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  47.96 
 
 
198 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  51.31 
 
 
198 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  46.63 
 
 
194 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  47.15 
 
 
198 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  49.01 
 
 
215 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  48.65 
 
 
195 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  48.65 
 
 
195 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  45.69 
 
 
206 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  45.69 
 
 
206 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  51.83 
 
 
196 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  48.17 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  50.54 
 
 
201 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  44.79 
 
 
198 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  45.36 
 
 
205 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  49.46 
 
 
200 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  44.92 
 
 
198 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  47.87 
 
 
196 aa  148  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  46.73 
 
 
200 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  46.73 
 
 
200 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  47.34 
 
 
200 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  45.5 
 
 
198 aa  147  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  41.21 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  46.73 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  53.98 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  46.73 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  48.17 
 
 
194 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  43.78 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  47.21 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  46.23 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  47.8 
 
 
197 aa  144  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2623  maf protein  47.26 
 
 
204 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  46.88 
 
 
203 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  49.21 
 
 
200 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  44.2 
 
 
192 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  45.18 
 
 
202 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  46.23 
 
 
207 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  48.11 
 
 
201 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  43.92 
 
 
195 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1734  Maf-like protein  44.16 
 
 
200 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  48.44 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  42.11 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  47.74 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  47.89 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  41.45 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  45.56 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  46.35 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  42.86 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  46.7 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  40.31 
 
 
196 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  46.88 
 
 
198 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  44.33 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  43.59 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  46.52 
 
 
202 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1708  maf protein  43.28 
 
 
208 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  43.96 
 
 
189 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  46.24 
 
 
213 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  44.75 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  44.75 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>