More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1255 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1255  maf protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  47.98 
 
 
199 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  48 
 
 
199 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  50 
 
 
196 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  47.18 
 
 
199 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  48.17 
 
 
202 aa  168  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  45.05 
 
 
202 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  46.96 
 
 
199 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  45.41 
 
 
202 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  45.69 
 
 
199 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  45.69 
 
 
199 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  48.74 
 
 
212 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  45.13 
 
 
199 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  47.16 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  43.07 
 
 
198 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  40.1 
 
 
199 aa  141  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  47.72 
 
 
204 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  44.72 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  40 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  40.41 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  40.61 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  44.16 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  45.92 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  47.72 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  41.9 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  41.9 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  44.85 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  44.68 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  43.65 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  44.68 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  41.9 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  41.34 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  36.31 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  34.02 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  32.99 
 
 
200 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  41.01 
 
 
202 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  41.99 
 
 
202 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  47.52 
 
 
204 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  41.44 
 
 
202 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  35.08 
 
 
191 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  35.08 
 
 
191 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  35.08 
 
 
203 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  35.08 
 
 
191 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  35.08 
 
 
191 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  35.08 
 
 
191 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  41.44 
 
 
203 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  47.25 
 
 
210 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  34.55 
 
 
191 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  35.18 
 
 
191 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  41.53 
 
 
197 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  33.51 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  32.98 
 
 
191 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  37.19 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  35.2 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  36.14 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1128  Maf-like protein  37.31 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  37.81 
 
 
199 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  35.6 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  32.46 
 
 
191 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  36.87 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  35.45 
 
 
193 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  32.99 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  36.41 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  34.52 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  35.68 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  36.27 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  34.18 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  35.03 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  33.84 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  37.95 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  33.84 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  33.84 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  33.84 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  30.73 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  33.84 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  33.84 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  32.66 
 
 
197 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  31.63 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  32.99 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  33.84 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  33.84 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  33.5 
 
 
194 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  32.84 
 
 
193 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  37.69 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  37.06 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  30.61 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  30.98 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  32.68 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  32.99 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  33.16 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  37.76 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  33.16 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  30.81 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  33.17 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  34.52 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  32.65 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  30.1 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0209  Maf-like protein  34.69 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  31.34 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  33.33 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>