More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1274 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  100 
 
 
204 aa  390  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  72.86 
 
 
204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  78.89 
 
 
210 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  70.27 
 
 
204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  69.73 
 
 
204 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  64.71 
 
 
203 aa  194  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  49.75 
 
 
202 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  54.31 
 
 
199 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  54.77 
 
 
202 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  52.26 
 
 
202 aa  167  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  47.62 
 
 
199 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  51.55 
 
 
199 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  50 
 
 
202 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  50.26 
 
 
199 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  45.13 
 
 
198 aa  151  7e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  50.75 
 
 
212 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  49.25 
 
 
202 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  54.14 
 
 
182 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  53.54 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  48.24 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  48.19 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  43.23 
 
 
196 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  47.59 
 
 
212 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  45.13 
 
 
198 aa  141  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  48.15 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  49.72 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  48.15 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  39.27 
 
 
195 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  44.56 
 
 
198 aa  138  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  41.26 
 
 
202 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  49.25 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  47.24 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  41.81 
 
 
198 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  36.92 
 
 
199 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  44 
 
 
197 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  39.27 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  41.24 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  44.63 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  34.72 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  42.86 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  34.72 
 
 
200 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  45.2 
 
 
197 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  44.07 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  40.41 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  40.93 
 
 
197 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  38.27 
 
 
219 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30 
 
 
203 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  30 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  36.08 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  30 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  30 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  30 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  30 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  29.47 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.82 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  30.65 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  36.13 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  33.85 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  29.03 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  35.45 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  38.27 
 
 
199 aa  95.1  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  28.49 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  36.13 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  35.42 
 
 
194 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  35.42 
 
 
194 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  35.42 
 
 
194 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  35.42 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  35.75 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  34.9 
 
 
194 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  31.61 
 
 
193 aa  92  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  34.67 
 
 
213 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  32.26 
 
 
191 aa  91.7  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  35.23 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  35.26 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  34.59 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  35.57 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  32.32 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  33.71 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0586  maf protein  32.11 
 
 
189 aa  89.4  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  29.38 
 
 
200 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  35.79 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  35.26 
 
 
192 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  35.26 
 
 
192 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  38.89 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0209  Maf-like protein  35.96 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  34.21 
 
 
197 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  32.81 
 
 
198 aa  87.8  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  38.8 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  30.89 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  34.2 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  35.23 
 
 
194 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  36.98 
 
 
199 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  33.33 
 
 
195 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  33.16 
 
 
198 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3284  maf protein  38.97 
 
 
199 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  33.65 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2637  maf protein  38.97 
 
 
199 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  36.6 
 
 
201 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  37.31 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  32.99 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>