More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0160 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  63.19 
 
 
202 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  61.88 
 
 
202 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  60.89 
 
 
202 aa  193  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  61.67 
 
 
202 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  59.63 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  61.49 
 
 
202 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  57.54 
 
 
199 aa  178  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  49.72 
 
 
199 aa  175  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  54.14 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  48.6 
 
 
202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  51.98 
 
 
199 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  51.12 
 
 
199 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  54.14 
 
 
204 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  53.59 
 
 
204 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  50.55 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  48.35 
 
 
199 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  48.35 
 
 
199 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  51.5 
 
 
199 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  47.7 
 
 
198 aa  153  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  48.17 
 
 
212 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  44.38 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  50.28 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  42.61 
 
 
198 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  48.89 
 
 
205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  38.86 
 
 
196 aa  131  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  39.08 
 
 
195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  41.82 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  54.14 
 
 
204 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  38.98 
 
 
198 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  53.23 
 
 
197 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  49.09 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  38.29 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  44.85 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  50.92 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  34.12 
 
 
200 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  36.97 
 
 
198 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  33.53 
 
 
200 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  37.35 
 
 
197 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  36.75 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  36.75 
 
 
197 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  32.78 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  39.05 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  36 
 
 
199 aa  94.4  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  36.31 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  33.13 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  32.34 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  32.34 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  36.05 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  30.11 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  33.33 
 
 
193 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  34.46 
 
 
197 aa  89  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  34.32 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  31.76 
 
 
195 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  28.8 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  36.81 
 
 
195 aa  87.8  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  34.81 
 
 
199 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  31.82 
 
 
194 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  32.4 
 
 
195 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  29.38 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  31.82 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  31.82 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  31.82 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  31.82 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  31.46 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  28.81 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  33.33 
 
 
201 aa  84.7  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  30.87 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  29.89 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  35.33 
 
 
199 aa  84.3  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  34.48 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  26.16 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  31.76 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  36.16 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  31.61 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  33.89 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  28.89 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  31.84 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  30 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  28.33 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  27.84 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  27.84 
 
 
191 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  28.41 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  27.84 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  27.84 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  28 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  28.89 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  33.33 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  27.84 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  34.97 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  33.33 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  32.58 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  28.81 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  31.14 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  32.7 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  27.12 
 
 
200 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  29.78 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  33.15 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  30.68 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>