More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1909 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  96.35 
 
 
192 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  88.02 
 
 
192 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1485  Maf-like protein  94.27 
 
 
192 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4162  Maf-like protein  74.48 
 
 
192 aa  266  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1623  Maf-like protein  68.91 
 
 
193 aa  265  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3837  maf protein  74.48 
 
 
192 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1642  Maf-like protein  74.71 
 
 
217 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.276282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25610  Maf-like protein  68.75 
 
 
192 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0482214  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2189  Maf-like protein  67.19 
 
 
192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14860  Maf-like protein  65.1 
 
 
192 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  57.07 
 
 
198 aa  204  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  55.56 
 
 
194 aa  201  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  54.74 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  50.79 
 
 
193 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  54.5 
 
 
194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  51.85 
 
 
195 aa  198  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  55.32 
 
 
193 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  54.05 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  54.55 
 
 
194 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  57.14 
 
 
199 aa  195  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  53.51 
 
 
194 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  53.19 
 
 
199 aa  194  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  53.51 
 
 
194 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  53.51 
 
 
194 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  52.97 
 
 
194 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1617  maf protein  57.14 
 
 
200 aa  191  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000874307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  51.32 
 
 
198 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  52.6 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  50.79 
 
 
207 aa  188  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  50.79 
 
 
207 aa  188  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  50.79 
 
 
207 aa  188  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  50.79 
 
 
207 aa  188  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  53.4 
 
 
191 aa  188  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  50.79 
 
 
207 aa  188  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  50.79 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  50.53 
 
 
199 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  53.65 
 
 
197 aa  187  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  50.79 
 
 
207 aa  187  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  50.79 
 
 
198 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  50.79 
 
 
198 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  48.94 
 
 
193 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  54.17 
 
 
206 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  51.06 
 
 
194 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  51.06 
 
 
194 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  51.85 
 
 
193 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  48.94 
 
 
196 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  51.83 
 
 
192 aa  185  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  50.79 
 
 
194 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  52.41 
 
 
193 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  50.53 
 
 
204 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  49.47 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2007  maf protein  51.89 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  51.58 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  46.6 
 
 
200 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  50 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  50.53 
 
 
194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  49.22 
 
 
204 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  48.94 
 
 
195 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0500  maf protein  52.41 
 
 
201 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002990  Maf/YceF/YhdE family protein  47.87 
 
 
193 aa  175  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000201354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  50 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  50.8 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2402  maf protein  49.22 
 
 
204 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000551046  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2128  maf protein  48.11 
 
 
194 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  52.88 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  48.72 
 
 
201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3284  maf protein  51.52 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2637  maf protein  51.52 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2127  maf protein  48.96 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0858484  normal  0.0145358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  48.65 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  48.13 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2299  maf protein  47 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000567223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1597  maf protein  48.39 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292492  hitchhiker  0.000898144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  51.06 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0401  maf protein  47.55 
 
 
212 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1239  maf protein  48.68 
 
 
193 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  41.12 
 
 
200 aa  158  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  47.34 
 
 
199 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3264  maf protein  49.47 
 
 
199 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  41.97 
 
 
195 aa  155  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  47.03 
 
 
205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.68 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  47.21 
 
 
206 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  46.63 
 
 
197 aa  151  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1986  septum formation protein Maf  48.96 
 
 
199 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000287921  hitchhiker  0.00293125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1557  Maf-like protein  50.53 
 
 
201 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19195  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  43.92 
 
 
192 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  43.92 
 
 
192 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  48.19 
 
 
191 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0633  hypothetical protein  47.87 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.684871  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  48.9 
 
 
198 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  48.35 
 
 
198 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  49.45 
 
 
194 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  47.64 
 
 
199 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5276  maf protein  48.42 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0997  Maf-like protein  47.87 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>