More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2299 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2299  maf protein  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000567223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  63.94 
 
 		 206 aa  263  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  62.62 
 
 		 194 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  62.62 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  61.17 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  62.14 
 
 		 194 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  62.62 
 
 		 194 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  63.11 
 
 		 204 aa  244  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  60.68 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  60.19 
 
 		 204 aa  241  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  60 
 
 		 193 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  58.21 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  58.21 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  58.21 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  58.21 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  58.21 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  58.21 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  58.21 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  58.21 
 
 		 207 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  58.21 
 
 		 207 aa  230  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1597  maf protein  60.58 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292492  hitchhiker  0.000898144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  57.77 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2402  maf protein  60.68 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000551046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  59.9 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  59.9 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  59.9 
 
 		 194 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  59.9 
 
 		 194 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  59.9 
 
 		 194 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  56.72 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002990  Maf/YceF/YhdE family protein  56.72 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000201354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  56.72 
 
 		 193 aa  214  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  53.88 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  54.95 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  59.9 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  55.33 
 
 		 195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  55.07 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  57.87 
 
 		 198 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  53.23 
 
 		 198 aa  210  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  57.87 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  57.36 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  54.46 
 
 		 194 aa  208  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  55.12 
 
 		 194 aa  207  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  56.7 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  53.2 
 
 		 200 aa  204  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1986  septum formation protein Maf  55.94 
 
 		 199 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000287921  hitchhiker  0.00293125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2128  maf protein  51.28 
 
 		 194 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1617  maf protein  55.68 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000874307  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  50.25 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25610  Maf-like protein  53.3 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0482214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2127  maf protein  50 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0858484  normal  0.0145358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  49.01 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2189  Maf-like protein  50.51 
 
 		 192 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  48.28 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1623  Maf-like protein  51.01 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  51.27 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  48.98 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14860  Maf-like protein  50.51 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  48.5 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  45.37 
 
 		 193 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  49.24 
 
 		 191 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  47.74 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4162  Maf-like protein  50.25 
 
 		 192 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3837  maf protein  48.76 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0500  maf protein  49.5 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  47.5 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  49.24 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1642  Maf-like protein  49.44 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.276282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  46.19 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  46.19 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  47 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  47.18 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2007  maf protein  46.46 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1485  Maf-like protein  47.72 
 
 		 192 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  45 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  47.21 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1068  Maf-like protein  47.76 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  46.04 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  43.84 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.81 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  44.06 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  44.67 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1557  Maf-like protein  46.8 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19195  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  43.15 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2916  Maf-like protein  46.77 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2857  Maf-like protein  50.25 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0526  Maf-like protein  50.25 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  44.88 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2796  Maf-like protein  50.25 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2798  Maf-like protein  50.25 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1807  Maf-like protein  50.25 
 
 		 215 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2484  Maf-like protein  50.25 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2911  Maf-like protein  50.25 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0633  hypothetical protein  49.25 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.684871  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  46.19 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0997  Maf-like protein  47.72 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0993  Maf-like protein  47.72 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  43.41 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1075  Maf-like protein  47.67 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0637  Maf-like protein  47.67 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0282745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1117  Maf-like protein  47.67 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>