More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2434 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  74.37 
 
 		 199 aa  276  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  73.6 
 
 		 198 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  73.1 
 
 		 198 aa  268  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  75 
 
 		 194 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  69.35 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1075  Maf-like protein  68.72 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0637  Maf-like protein  69.23 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0282745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1117  Maf-like protein  69.23 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1068  Maf-like protein  66.33 
 
 		 205 aa  244  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0997  Maf-like protein  69.07 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0993  Maf-like protein  69.07 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1713  Maf-like protein  69.39 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2916  Maf-like protein  64.68 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1807  Maf-like protein  69.9 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0526  Maf-like protein  69.9 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2798  Maf-like protein  69.9 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2857  Maf-like protein  69.9 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2796  Maf-like protein  69.9 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2484  Maf-like protein  69.9 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2911  Maf-like protein  69.9 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4229  Maf-like protein  69.07 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2187  Maf-like protein  68.04 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  61.34 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  61.62 
 
 		 191 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  57.79 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  58.29 
 
 		 205 aa  214  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  57.29 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0401  maf protein  60.1 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1557  Maf-like protein  61.9 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19195  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  54.64 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  56.15 
 
 		 192 aa  208  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  57.92 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0633  hypothetical protein  62.03 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.684871  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  57.3 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  55.56 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  50.25 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  55.68 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  52.13 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  55.32 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  52.13 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  52.13 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  52.13 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  52.13 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  52.15 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0500  maf protein  54.97 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3284  maf protein  56.99 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2637  maf protein  56.99 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  48.42 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  49.2 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  49.2 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  49.2 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  49.2 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  49.2 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  49.2 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  49.2 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  49.2 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  49.2 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3264  maf protein  55.85 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5276  maf protein  57.45 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  49.47 
 
 		 197 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  47.34 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  46.63 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  50 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  43.39 
 
 		 193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  53.72 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.39 
 
 		 197 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  47.57 
 
 		 193 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  48.13 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  48.13 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  48.15 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  48.11 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  48.13 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  48.11 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  43.01 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  55.38 
 
 		 189 aa  167  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  46.24 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  50 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  45.7 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  44.39 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  47.09 
 
 		 195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1623  Maf-like protein  49.47 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2007  maf protein  48.11 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  48.65 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2127  maf protein  44.22 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0858484  normal  0.0145358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2128  maf protein  45.5 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  46.84 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  45.36 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  47.06 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2299  maf protein  45 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000567223  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3837  maf protein  51.34 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  44.56 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  45.5 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  46.49 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  47.03 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  46.81 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  46.81 
 
 		 194 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  47.06 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2189  Maf-like protein  51.37 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  44.44 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>