More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0615 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0633  hypothetical protein  72.02 
 
 		 205 aa  244  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.684871  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  61.93 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  65.41 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  63.24 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  64.02 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2637  maf protein  68.42 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3284  maf protein  68.42 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  62.16 
 
 		 201 aa  217  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  62.18 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  58.29 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  61.05 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  57.3 
 
 		 191 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5276  maf protein  69.89 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3264  maf protein  64.32 
 
 		 199 aa  204  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0401  maf protein  60.96 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0997  Maf-like protein  60.7 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0993  Maf-like protein  60.7 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  55.14 
 
 		 198 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1713  Maf-like protein  60.21 
 
 		 236 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1068  Maf-like protein  58.95 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2916  Maf-like protein  59.47 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0637  Maf-like protein  61.38 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0282745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1117  Maf-like protein  61.38 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1075  Maf-like protein  61.38 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2187  Maf-like protein  61.58 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.165473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  54.1 
 
 		 193 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  52.11 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0526  Maf-like protein  58.95 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2857  Maf-like protein  58.95 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2796  Maf-like protein  58.95 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1807  Maf-like protein  58.95 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2798  Maf-like protein  58.95 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2911  Maf-like protein  58.95 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2484  Maf-like protein  58.95 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  50.8 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1557  Maf-like protein  54.4 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19195  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  53.97 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4229  Maf-like protein  60.32 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  47.4 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  59.46 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  47.4 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  47.4 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  56.84 
 
 		 191 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  47.57 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  55.68 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  44.97 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  52.38 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  47.15 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  47.4 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  47.4 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  45.41 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  47.15 
 
 		 194 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  47.4 
 
 		 194 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  50.78 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  54.59 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  44.74 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  45.41 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  45.41 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  45.41 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  45.41 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  45.41 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  45.41 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0500  maf protein  51.83 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  54.05 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  46.56 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  45.83 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  45.83 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  46.84 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  50.26 
 
 		 197 aa  171  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  48.44 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  45.79 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  45.83 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  46.35 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  50 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  46.88 
 
 		 195 aa  167  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1623  Maf-like protein  49.21 
 
 		 193 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  44.57 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  46.49 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  45.36 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  45.26 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  47.67 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  45.96 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  47.62 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  47.62 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1617  maf protein  46.03 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000874307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  47.31 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  46.84 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  47.09 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2127  maf protein  42.56 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0858484  normal  0.0145358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  49.47 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  49.47 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1597  maf protein  47.64 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292492  hitchhiker  0.000898144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2299  maf protein  47.21 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000567223  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  46.77 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  47.03 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2128  maf protein  44.15 
 
 		 194 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1986  septum formation protein Maf  48.39 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000287921  hitchhiker  0.00293125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  42.56 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  43.62 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>