More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2831 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2831  maf protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  52.82 
 
 
198 aa  202  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  51.55 
 
 
202 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  51.28 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  43.81 
 
 
199 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  50 
 
 
195 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  50.51 
 
 
197 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  50.51 
 
 
197 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  49.49 
 
 
197 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  48.98 
 
 
202 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  43.92 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  44.44 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  43.81 
 
 
199 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  43.81 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  42.46 
 
 
198 aa  141  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  44.21 
 
 
202 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  42.86 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  41.57 
 
 
199 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  39.89 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  39.89 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  43.5 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  46.43 
 
 
197 aa  121  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  41.84 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  40.22 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  38.14 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  42.56 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  41.11 
 
 
202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  38.71 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  38.71 
 
 
204 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  40.45 
 
 
202 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  41.54 
 
 
202 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  35.43 
 
 
212 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  43 
 
 
212 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  42.22 
 
 
202 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  44.1 
 
 
204 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  36.04 
 
 
194 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  36.04 
 
 
194 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  36.04 
 
 
194 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  42.11 
 
 
202 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  36.04 
 
 
194 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  40.82 
 
 
205 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  35.53 
 
 
194 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  41.34 
 
 
182 aa  98.2  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  30.32 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  30.32 
 
 
200 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  41.99 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  35.53 
 
 
194 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  35.53 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  35.53 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  35.53 
 
 
207 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  35.53 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  35.53 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  35.03 
 
 
207 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  35.53 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.46 
 
 
197 aa  92  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  34.54 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  45.56 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  31.98 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  30.46 
 
 
194 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  31.47 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  32.31 
 
 
199 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1623  Maf-like protein  32.82 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  32.82 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  30.89 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  35.03 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  35.03 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  30 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  32.82 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  31.79 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  33.16 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  32.31 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  32.04 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  35.38 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  32.49 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  31.94 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  32.49 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  35.42 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2402  maf protein  33.33 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000551046  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  33.16 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  31.47 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  30.46 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  31.12 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  32.65 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  32.65 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  32.65 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  29.74 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  32.99 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  31.32 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  30.26 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  29.7 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  30.35 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  28.65 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  27.51 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  28.57 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  28.65 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  32.14 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  29.06 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  33.82 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  24.75 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>