More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3614 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  100 
 
 
202 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  49.74 
 
 
199 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  47.34 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  48.45 
 
 
202 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  44.62 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  46.88 
 
 
196 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  40.93 
 
 
199 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  47.52 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  41.62 
 
 
199 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  41.99 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  41.99 
 
 
199 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  41.54 
 
 
195 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  41.99 
 
 
199 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  45.64 
 
 
202 aa  141  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  46.59 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  40 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  47.69 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  39.9 
 
 
198 aa  134  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  40.88 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  40.93 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  44.72 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  41.48 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  40.91 
 
 
197 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  37.71 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  41.72 
 
 
182 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  44.62 
 
 
202 aa  124  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  39.77 
 
 
197 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  41.03 
 
 
212 aa  121  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  42.86 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  41.24 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  37.44 
 
 
198 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  43.5 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  43.3 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  36.04 
 
 
192 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  40.11 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  42.35 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  39.46 
 
 
204 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  36.92 
 
 
198 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1623  Maf-like protein  37.88 
 
 
193 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.58 
 
 
197 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  38.38 
 
 
204 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  38.14 
 
 
195 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  38.07 
 
 
193 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  37.24 
 
 
199 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  39.09 
 
 
199 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  31.91 
 
 
200 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  31.91 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  37.56 
 
 
219 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  36.41 
 
 
192 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0401  maf protein  35.86 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  33.16 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  31.44 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1872  maf protein  36.5 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.394166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  35.03 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  35.03 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  42.86 
 
 
204 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  35.2 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  36.41 
 
 
187 aa  94  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3080  maf protein  36.04 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  33.85 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  33.68 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  33.16 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  36.59 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  33.16 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  31.44 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2189  Maf-like protein  36.55 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  33.16 
 
 
194 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  35.5 
 
 
199 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  33.16 
 
 
194 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  35.42 
 
 
201 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  31.63 
 
 
193 aa  92  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  33.16 
 
 
194 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  37.19 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  39.89 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  29.69 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  38.34 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  33.85 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1726  maf protein  35.57 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  30.93 
 
 
200 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  36.31 
 
 
203 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  31.96 
 
 
193 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4162  Maf-like protein  36.41 
 
 
192 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322782  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  32.11 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  36.68 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  30.77 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  37.06 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  37.06 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  32.47 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  30.5 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  34.2 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  35.08 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  31.44 
 
 
207 aa  85.1  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  31.09 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2602  maf protein  32.96 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25610  Maf-like protein  35.03 
 
 
192 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0482214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  30.5 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  30.5 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  30.5 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  30.5 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  30.5 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>