More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1491 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  100 
 
 
204 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  91.67 
 
 
204 aa  307  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  91.18 
 
 
204 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  58.71 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  72.86 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  54.73 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  69.5 
 
 
203 aa  197  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  59.2 
 
 
202 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  70.85 
 
 
210 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  54.45 
 
 
199 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  54.04 
 
 
199 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  53.23 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  55.29 
 
 
212 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  52.36 
 
 
199 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  55 
 
 
202 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  50.53 
 
 
202 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  50.28 
 
 
202 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  47.96 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  54.14 
 
 
182 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  53.96 
 
 
205 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  51.93 
 
 
212 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  50 
 
 
199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  51.32 
 
 
199 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  51.32 
 
 
199 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  44.85 
 
 
199 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  50.85 
 
 
199 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  45.03 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  45.92 
 
 
198 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  43.37 
 
 
202 aa  141  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  51.55 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  39.79 
 
 
195 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  43.01 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  37.11 
 
 
200 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  36.6 
 
 
200 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  47.72 
 
 
212 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  39.58 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  46.33 
 
 
197 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  45.76 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  37 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  45.2 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  42.86 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  41.88 
 
 
197 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  40 
 
 
197 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  36.92 
 
 
199 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  41.54 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  37.82 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  37.31 
 
 
192 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  36.98 
 
 
187 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  37.5 
 
 
194 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  40.41 
 
 
193 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  36.27 
 
 
191 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  38.98 
 
 
198 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  37.5 
 
 
194 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  37.5 
 
 
194 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  37.5 
 
 
194 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  35.45 
 
 
209 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  37.5 
 
 
194 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  39.89 
 
 
197 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.69 
 
 
203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  30.69 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  30.69 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  30.69 
 
 
191 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  30.69 
 
 
191 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  30.69 
 
 
191 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  35.75 
 
 
201 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  41.81 
 
 
200 aa  101  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  34.9 
 
 
189 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  38.65 
 
 
199 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1239  maf protein  41.27 
 
 
193 aa  101  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  37.57 
 
 
192 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  37.57 
 
 
192 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  41.33 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  30.16 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  33.51 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  35.38 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  36.41 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  30.81 
 
 
191 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  36.79 
 
 
191 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  32.31 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  39.9 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  41.33 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  33.86 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  41.33 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  39.09 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  38.71 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  36.73 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  29.1 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  35.23 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  36.98 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  33.16 
 
 
207 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  28.57 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  35.08 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  36.16 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  33.51 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  35.08 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  35.08 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  31.02 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  35.08 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  35.08 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  33.33 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>