More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3210 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  68.18 
 
 		 199 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  65.66 
 
 		 199 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  60.2 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  62.81 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  62.81 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  60.8 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  51.76 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  49.49 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  49.74 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  46.97 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  46.63 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  54.45 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  43.81 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  40.91 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  49.72 
 
 		 182 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  48.17 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  52.2 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  50.78 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  51.65 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  49.48 
 
 		 202 aa  150  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  47.19 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  48 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  50.28 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  44.62 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  45.71 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  50.26 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  49.74 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  41.45 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  45.14 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  40.72 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  42.94 
 
 		 212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  44.57 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  44 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  44 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  45.08 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  53.63 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  43.02 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  50 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  47.75 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  32.12 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  32.12 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  35.23 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  36.27 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  38.19 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  33.51 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  33.51 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  33.51 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  33.51 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  33.51 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  33.51 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  37.31 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  32.98 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  34.2 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  33.85 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  34.67 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  35.82 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  33.85 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  34.36 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  33.85 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  33.85 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  34.72 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  34.36 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  34.36 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  34.36 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  32.11 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  36.92 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  34.36 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  32.63 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  34.36 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  34.36 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  34.36 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  34.36 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  32.11 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  33.33 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  34.87 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  36.95 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  30.81 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  31.96 
 
 		 192 aa  94.4  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  29.15 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  33.68 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2602  maf protein  33.68 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  35.53 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  36.45 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  35.53 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  32.49 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  31.61 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  31.47 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  34.34 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  36.22 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  36.45 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  33.5 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  33.67 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  35.53 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  35.03 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  31.98 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  33.85 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  33.85 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  33.5 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  37.76 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>