More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0116 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  42.02 
 
 
202 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  43.65 
 
 
198 aa  154  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  42.41 
 
 
198 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  44.04 
 
 
202 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  45.03 
 
 
202 aa  147  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  50 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  40.72 
 
 
199 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  41.58 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  39.31 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  42.33 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  42.71 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  40.31 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  41.04 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  39.18 
 
 
199 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  41.54 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  39.06 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  39.47 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  39.49 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  41.36 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  39.06 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  40.68 
 
 
202 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  38.22 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  46.19 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  39.79 
 
 
204 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  37.71 
 
 
198 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  35.26 
 
 
198 aa  118  6e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  38.15 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  39.34 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  39.43 
 
 
212 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  38.8 
 
 
204 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  37.89 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  32.98 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  35.14 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  34.05 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  37.29 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  39.9 
 
 
212 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  35.94 
 
 
198 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  33.51 
 
 
195 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  35.23 
 
 
197 aa  101  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  39.27 
 
 
204 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  40.57 
 
 
210 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  33.86 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  31.44 
 
 
194 aa  94.4  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  35.94 
 
 
201 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  35.59 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  32.65 
 
 
195 aa  92.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0824  Maf-like protein  34.9 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772953  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  32.29 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  35.03 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  31.77 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  37.5 
 
 
203 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  34.46 
 
 
197 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  33.85 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0401  maf protein  35.26 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  34.9 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1597  maf protein  31.96 
 
 
198 aa  87  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292492  hitchhiker  0.000898144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  30.89 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  35.79 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1571  Maf-like protein  31.44 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000928648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1068  maf protein  30.89 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3505  Maf-like protein  31.44 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000678073  hitchhiker  0.0069298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  30.3 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2814  Maf-like protein  30.41 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000026999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  31.77 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1900  maf protein  35.05 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000961367  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  32.31 
 
 
194 aa  84.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  33.51 
 
 
191 aa  84.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  31.96 
 
 
207 aa  84.3  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1680  Maf-like protein  30.93 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02914  Maf-like protein  30.93 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  31.96 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  31.96 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  31.96 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  31.96 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  31.96 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  31.96 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.69 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  31.96 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  31.96 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  31.96 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1239  maf protein  34.9 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  30.73 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1075  Maf-like protein  35.26 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0637  Maf-like protein  34.74 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0282745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1117  Maf-like protein  34.74 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2654  maf protein  30.73 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000896641  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  27.41 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1710  maf protein  30.73 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  30.89 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1753  maf protein  30.73 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021819  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2127  maf protein  31 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0858484  normal  0.0145358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1576  maf protein  30.73 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2128  maf protein  32.11 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2402  maf protein  31.77 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000551046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>