More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0113 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0113  maf protein  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  81.68 
 
 
202 aa  298  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  62.87 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  61.88 
 
 
202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  60.4 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  58.71 
 
 
204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  60.89 
 
 
202 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  60.89 
 
 
182 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  56.76 
 
 
204 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  53.54 
 
 
199 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  55.68 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  54.5 
 
 
212 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  49.48 
 
 
199 aa  171  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  54.77 
 
 
205 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  50.52 
 
 
199 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  48.21 
 
 
198 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  45.03 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  46.15 
 
 
198 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  46.11 
 
 
202 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  46.03 
 
 
199 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  44.9 
 
 
202 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  47.94 
 
 
199 aa  154  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  48.17 
 
 
199 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  48.17 
 
 
199 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  41.75 
 
 
200 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  52.26 
 
 
204 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  54.77 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  48.9 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  41.24 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  43.81 
 
 
198 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  42.93 
 
 
196 aa  141  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  45.88 
 
 
202 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  47.8 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  42.2 
 
 
212 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  49.74 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  37.31 
 
 
199 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  44.16 
 
 
212 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  42.61 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  37.11 
 
 
197 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  37.5 
 
 
197 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  36.6 
 
 
195 aa  104  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  40 
 
 
197 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  35.11 
 
 
209 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  39.55 
 
 
197 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  34.36 
 
 
198 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  39.55 
 
 
197 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  39.55 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  36.08 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  36.73 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  35.53 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  31.91 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  31.91 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  31.91 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  37.99 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  31.91 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  31.91 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  31.91 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  33.83 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  33.85 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  37.57 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1464  maf protein  29.57 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  32.81 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  29.9 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  32.46 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  31.96 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  35.11 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  35.11 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  31.38 
 
 
191 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  35.11 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  35.11 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  35.11 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  37.37 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  33.85 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  33.15 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  33.85 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  30.32 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  37.17 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  34.55 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  30.85 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  33.16 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  34.07 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  36.81 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  30.32 
 
 
191 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  31.28 
 
 
197 aa  89  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.38 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  34.95 
 
 
197 aa  89  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  35.26 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  34.38 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  29.17 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  32.47 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  32.29 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  37.24 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  29.38 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  37.1 
 
 
197 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  34.04 
 
 
197 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  28.64 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  32.99 
 
 
194 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2269  Maf-like protein  30.77 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  37.1 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  29.44 
 
 
220 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>