More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0404 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  100 
 
 
220 aa  446  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  58.33 
 
 
192 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  58.12 
 
 
193 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  57.59 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  55.26 
 
 
194 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  59.57 
 
 
191 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  55.08 
 
 
199 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  53.01 
 
 
194 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  48.15 
 
 
193 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  47.89 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  45.31 
 
 
197 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  47.28 
 
 
207 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  44.79 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  44.79 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  46.32 
 
 
191 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  44.79 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  44.79 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  44.27 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  44.79 
 
 
197 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  43.75 
 
 
197 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  43.75 
 
 
197 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  48.96 
 
 
197 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  46.19 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  45.6 
 
 
197 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  45.69 
 
 
196 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  48.37 
 
 
197 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  45.45 
 
 
193 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  46.6 
 
 
201 aa  149  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  46.24 
 
 
201 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  44.5 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  42.31 
 
 
192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  45.5 
 
 
205 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  45.74 
 
 
194 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  45.5 
 
 
193 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  48.65 
 
 
198 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  45.26 
 
 
194 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  44.21 
 
 
197 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  44.5 
 
 
197 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  44.5 
 
 
197 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  44.5 
 
 
197 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  44.68 
 
 
194 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  45.16 
 
 
199 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3341  maf protein  45.88 
 
 
191 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105498  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  43.62 
 
 
192 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  43.78 
 
 
192 aa  141  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  46.2 
 
 
198 aa  141  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  46.45 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  43.85 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  45.31 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4353  maf protein  46.07 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000929678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  45.31 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  39.89 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  44.62 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2269  Maf-like protein  41.71 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  45.31 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  45.99 
 
 
205 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  43.68 
 
 
197 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  42.19 
 
 
194 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1652  Maf-like protein  41.71 
 
 
197 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  47.85 
 
 
191 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  45.92 
 
 
200 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  43.62 
 
 
203 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  46.32 
 
 
201 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  43.48 
 
 
189 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  42.47 
 
 
191 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  43.85 
 
 
198 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  43.46 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0693  maf protein  43.24 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  44.15 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  42.86 
 
 
192 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  44.68 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  40.7 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  43.16 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  39.81 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  43.55 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  40.31 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1581  maf protein  41.29 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.688368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3832  maf protein  44.44 
 
 
197 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0290532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  42.63 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  43.85 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  43.32 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  42.27 
 
 
198 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  41.18 
 
 
189 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  41.92 
 
 
200 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  43.46 
 
 
198 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  41.71 
 
 
189 aa  131  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  41.92 
 
 
200 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  44.39 
 
 
200 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  43.09 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2414  Maf-like protein  44.74 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.018191  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  40.32 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  41.88 
 
 
212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  40.1 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  41.27 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  39.25 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  39.78 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  42.33 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  39.25 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  42.33 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  38.83 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>