More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2414 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2414  Maf-like protein  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.018191  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2587  Maf-like protein  65.46 
 
 
216 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0640  Maf-like protein  57.65 
 
 
219 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  49.25 
 
 
209 aa  177  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1747  Maf-like protein  49.77 
 
 
243 aa  171  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1581  maf protein  49.26 
 
 
217 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.688368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  50.26 
 
 
201 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  45.95 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  40.61 
 
 
191 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  40.61 
 
 
191 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  44.32 
 
 
191 aa  148  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  40.61 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  40.61 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  40.61 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  47.54 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  40.61 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  40.1 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  39.39 
 
 
203 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  44.02 
 
 
186 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  45.36 
 
 
191 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  45.45 
 
 
193 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  46.39 
 
 
209 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  39.59 
 
 
191 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  44.74 
 
 
220 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  45.64 
 
 
213 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  44.92 
 
 
193 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  45.36 
 
 
209 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  44.85 
 
 
194 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  39.89 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  43.23 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  44.57 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  43.78 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  43.59 
 
 
202 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  49.46 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  43.92 
 
 
200 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  43.81 
 
 
191 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0649  maf protein  40.57 
 
 
220 aa  137  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733747  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  45.73 
 
 
210 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  45.05 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  47.89 
 
 
194 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  43.32 
 
 
193 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  46.11 
 
 
228 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  40.86 
 
 
191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  46.56 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  39.79 
 
 
199 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  43.01 
 
 
199 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  46.24 
 
 
187 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  38.8 
 
 
189 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  44.44 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  46.88 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  45.05 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  44.39 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  45.45 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  44.62 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  43.56 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  46.7 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  39.47 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  42.86 
 
 
194 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  41.67 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  42.47 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  45.08 
 
 
194 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  42.11 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  40.62 
 
 
208 aa  131  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  40.43 
 
 
191 aa  131  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  39.66 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  44.62 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05420  MAF protein  43.72 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.417777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  46.2 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  43.09 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_938  maf-like protein  42.13 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  44.62 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  39.13 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  42.02 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  43.39 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  42.86 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  42.47 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  43.48 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  43.39 
 
 
196 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  41.15 
 
 
208 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  40.82 
 
 
201 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2955  Maf-like protein  38.04 
 
 
194 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  44.04 
 
 
194 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2360  maf protein  38.2 
 
 
245 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00952964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  41.15 
 
 
207 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  44.44 
 
 
210 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  45.69 
 
 
201 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  44.44 
 
 
210 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  42.55 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  42.55 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  46.32 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  42.55 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  42.02 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  42.55 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  46.88 
 
 
196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  42.55 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  40.76 
 
 
189 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  42.02 
 
 
197 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  42.93 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  44.09 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  41.18 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>