More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2587 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2587  Maf-like protein  100 
 
 
216 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2414  Maf-like protein  65.46 
 
 
210 aa  227  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.018191  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0640  Maf-like protein  61.19 
 
 
219 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  51.31 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1747  Maf-like protein  48.87 
 
 
243 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  50.25 
 
 
213 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1581  maf protein  49.26 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.688368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  47.09 
 
 
191 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  47.62 
 
 
192 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  50.27 
 
 
201 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  47.34 
 
 
194 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  46.7 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  48.65 
 
 
187 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  42.93 
 
 
200 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  49.2 
 
 
194 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  43.3 
 
 
193 aa  141  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  44.27 
 
 
207 aa  141  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  46.32 
 
 
203 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  39.78 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  39.78 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  39.78 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  41.62 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  43.32 
 
 
197 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  39.78 
 
 
203 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  39.78 
 
 
191 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  47.59 
 
 
194 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  39.78 
 
 
191 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  48.66 
 
 
194 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  44.56 
 
 
199 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  44.92 
 
 
199 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  47.09 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  43.72 
 
 
191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  41.08 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  44.1 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  45.55 
 
 
196 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  45.36 
 
 
193 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  47.54 
 
 
200 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  39.25 
 
 
191 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  46.56 
 
 
203 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  43.65 
 
 
198 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  40 
 
 
191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  45.36 
 
 
193 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  45.16 
 
 
197 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  45.16 
 
 
197 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  46.45 
 
 
199 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  45.16 
 
 
197 aa  134  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  38.17 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  37.89 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  43.48 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  37.63 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  44.61 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  44.61 
 
 
210 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  39.68 
 
 
191 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  42.86 
 
 
240 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  42.39 
 
 
197 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  44.04 
 
 
195 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  48.35 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  44.5 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2257  maf protein  44.66 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  39.89 
 
 
191 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  43.65 
 
 
191 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  46.81 
 
 
205 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  44.62 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  44.62 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  44.62 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  44.62 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  44.62 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  44.39 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  40.45 
 
 
186 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  40.64 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  41.29 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  43.48 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  44.44 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  43.48 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  47.34 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  43.48 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  43.48 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  40.89 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  39.9 
 
 
201 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  46.32 
 
 
203 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  42.49 
 
 
201 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  39.9 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  42.27 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  41.21 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  43.75 
 
 
197 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  44.44 
 
 
200 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  46.77 
 
 
192 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  40.82 
 
 
198 aa  128  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  44.32 
 
 
197 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  41.84 
 
 
194 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  44.21 
 
 
201 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1652  Maf-like protein  40.64 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  46.28 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  40.93 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2360  maf protein  38.21 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00952964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  39.58 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  42.27 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  42.27 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05420  MAF protein  44.22 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.417777  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  41.36 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>