More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_938 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_938  maf-like protein  100 
 
 
224 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0949  maf protein  77.58 
 
 
224 aa  363  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1120  septum formation protein MaF  72.07 
 
 
224 aa  335  5e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.500254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  43.32 
 
 
192 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  42.02 
 
 
193 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  41.71 
 
 
199 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  39.67 
 
 
191 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  41.05 
 
 
192 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  39.67 
 
 
189 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  39.89 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  38.62 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  39.89 
 
 
197 aa  131  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  37.31 
 
 
199 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  40 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2269  Maf-like protein  40.43 
 
 
195 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0693  maf protein  40.51 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3341  maf protein  41.11 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105498  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  39.58 
 
 
213 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  36.6 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2360  maf protein  36.07 
 
 
245 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00952964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1652  Maf-like protein  39.36 
 
 
197 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  38.83 
 
 
186 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  38.38 
 
 
201 aa  124  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1581  maf protein  40.32 
 
 
217 aa  124  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.688368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  38.71 
 
 
220 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  36.96 
 
 
191 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  38.62 
 
 
191 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  40.54 
 
 
187 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2348  maf protein  37.5 
 
 
203 aa  122  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000032601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  42.02 
 
 
201 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  36.41 
 
 
193 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1468  maf protein  42.94 
 
 
203 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  36.96 
 
 
194 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  37.63 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  38.86 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  38.1 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  38.1 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3755  maf protein  35.68 
 
 
212 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.563863  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  37.84 
 
 
192 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  37.04 
 
 
203 aa  118  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2414  Maf-like protein  41.54 
 
 
210 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.018191  normal  0.131362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  37.57 
 
 
191 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  36.65 
 
 
191 aa  118  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  33.68 
 
 
194 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  37.57 
 
 
191 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  36.76 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  37.04 
 
 
191 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1564  maf protein  37.98 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  35.87 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  36.41 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  36.17 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1959  maf protein  38.3 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  36.76 
 
 
191 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  36.23 
 
 
200 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  36.22 
 
 
191 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  36.26 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  36.51 
 
 
191 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0960  maf protein  37.31 
 
 
197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  37.3 
 
 
192 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  36.76 
 
 
191 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2424  maf protein  37.97 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.337615  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  34.2 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1308  Maf-like protein  35.08 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.104228  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0906  maf protein  41.88 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  31.75 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  35.64 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  38.25 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  36.27 
 
 
200 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  36.51 
 
 
194 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  36.76 
 
 
193 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1747  Maf-like protein  38.32 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02160  MAF protein  38.78 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0690685  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  34.38 
 
 
200 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  36.96 
 
 
198 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  35.45 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1082  maf protein  35.18 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.14681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  37.97 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1527  maf protein  38.3 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  35.45 
 
 
194 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0657  Maf-like protein  35.64 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.268299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  34.63 
 
 
201 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  34.21 
 
 
195 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  34.21 
 
 
195 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  35.83 
 
 
194 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1119  maf protein  35.26 
 
 
223 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117235  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  37.16 
 
 
198 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  36.87 
 
 
200 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  34.45 
 
 
240 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2837  Maf-like protein  35.11 
 
 
205 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00477693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  36.22 
 
 
191 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  32.67 
 
 
212 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  37.97 
 
 
203 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1295  Maf-like protein  32.72 
 
 
209 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308196  normal  0.077241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  37.37 
 
 
205 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  35.57 
 
 
210 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  37.43 
 
 
202 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3266  Maf-like protein  33.18 
 
 
209 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  33.51 
 
 
213 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  34.22 
 
 
196 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3211  maf protein  37.63 
 
 
189 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184391  normal  0.322593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>