More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1527 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1527  maf protein  100 
 
 
192 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0960  maf protein  57.81 
 
 
197 aa  239  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1393  Maf-like protein  59.36 
 
 
196 aa  235  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0131131  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1082  maf protein  59.9 
 
 
198 aa  227  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.14681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1359  maf protein  50.27 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0215865  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1119  maf protein  48.68 
 
 
223 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117235  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1179  Maf-like protein  50.52 
 
 
193 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.152548 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  43.01 
 
 
191 aa  147  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  43.01 
 
 
203 aa  147  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  42.47 
 
 
191 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  42.47 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  42.47 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  42.47 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  42.47 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  41.94 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  43.01 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  40.32 
 
 
191 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  40.86 
 
 
199 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  41.94 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0214  maf protein  42.08 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  41.27 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  41.18 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1959  maf protein  40.44 
 
 
192 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  39.57 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  39.15 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  41.15 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  37.77 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3341  maf protein  39.68 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105498  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  39.25 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1464  maf protein  36.13 
 
 
190 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  38.62 
 
 
192 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  39.27 
 
 
200 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  37.57 
 
 
191 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2424  maf protein  39.57 
 
 
191 aa  124  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.337615  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  40.82 
 
 
213 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  35.64 
 
 
189 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  39.67 
 
 
186 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  37.23 
 
 
197 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  37.23 
 
 
197 aa  121  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  37.37 
 
 
207 aa  121  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  37.23 
 
 
197 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  39.25 
 
 
201 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0693  maf protein  39.58 
 
 
200 aa  121  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  36.7 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  36.7 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  36.7 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  36.7 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  36.7 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  36.7 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  38.3 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  39.04 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  39.58 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  38.1 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  36.17 
 
 
197 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  36.17 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  39.78 
 
 
201 aa  118  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  35.29 
 
 
192 aa  118  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  36.36 
 
 
197 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  36.7 
 
 
201 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  36.17 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  39.68 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  37.63 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  36.9 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  38.8 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  38.71 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  38.17 
 
 
191 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  38.5 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  37.44 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  38.25 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  37.17 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  36.7 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  37.63 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  36.93 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  38.17 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  38.54 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  37.31 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  37.97 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0657  Maf-like protein  37.5 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.268299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  35.64 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  37.1 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  40.11 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  38.3 
 
 
192 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  35.64 
 
 
194 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  36.02 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  37.57 
 
 
220 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  36.02 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  34.81 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  39.11 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  36.02 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2901  maf protein  34.09 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  36.02 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  36.02 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  37.3 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  35.8 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  35.8 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_938  maf-like protein  38.3 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2955  Maf-like protein  35.71 
 
 
194 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  35.83 
 
 
205 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  36.17 
 
 
207 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  34.78 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>