More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0960 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0960  maf protein  100 
 
 
197 aa  411  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1527  maf protein  57.81 
 
 
192 aa  239  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1082  maf protein  56.7 
 
 
198 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.14681  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1393  Maf-like protein  52.36 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0131131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1119  maf protein  51.63 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117235  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1359  maf protein  51.89 
 
 
201 aa  195  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0215865  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1179  Maf-like protein  48.42 
 
 
193 aa  177  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.152548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  41.18 
 
 
199 aa  148  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  41.21 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  43.01 
 
 
191 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  43.01 
 
 
191 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  43.01 
 
 
191 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  43.01 
 
 
191 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  43.01 
 
 
191 aa  141  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  43.01 
 
 
203 aa  141  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  41.94 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  42.47 
 
 
191 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  41.67 
 
 
191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  41.94 
 
 
191 aa  138  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1959  maf protein  41.11 
 
 
192 aa  137  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  44.09 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  42.02 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  41.05 
 
 
191 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  44.32 
 
 
186 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1236  Maf-like protein  42.08 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1219  Maf-like protein  42.08 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  43.5 
 
 
201 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  43.09 
 
 
201 aa  131  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  42.05 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1308  Maf-like protein  40.84 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.104228  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  42.63 
 
 
192 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  41.48 
 
 
197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  39.68 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  42.05 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  42.05 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  42.05 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  42.05 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  42.05 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  40.91 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  39.27 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  39.68 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  40.43 
 
 
192 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0657  Maf-like protein  38.78 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.268299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  42.05 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002386  septum formation protein Maf  42.22 
 
 
189 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  39.15 
 
 
192 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  37.84 
 
 
189 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  39.58 
 
 
193 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  40.34 
 
 
197 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  40.43 
 
 
191 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  40.88 
 
 
198 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  42.19 
 
 
198 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  40.88 
 
 
198 aa  121  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  41.08 
 
 
213 aa  121  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  37.31 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  40.34 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3341  maf protein  38.62 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105498  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  39.06 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1464  maf protein  38.59 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2424  maf protein  36.9 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.337615  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  37.57 
 
 
196 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0214  maf protein  38.59 
 
 
182 aa  119  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  37.5 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  40.41 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  39.58 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3211  maf protein  37.43 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184391  normal  0.322593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  38.92 
 
 
198 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  36.79 
 
 
193 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  40.84 
 
 
194 aa  117  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  40.91 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  40.96 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  35.11 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  39.2 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  39.2 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  39.33 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  36.9 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  40.34 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  38.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  39.2 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  39.2 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  36.6 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  39.2 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  40.34 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_938  maf-like protein  37.31 
 
 
224 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0906  maf protein  37.37 
 
 
199 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  39.01 
 
 
201 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  37.97 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  41.01 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  39.57 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  41.48 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  41.48 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  38.89 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  39.25 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  39.33 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  37.76 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  39.77 
 
 
197 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  36.07 
 
 
200 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0693  maf protein  38.3 
 
 
200 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  39.77 
 
 
197 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  39.77 
 
 
197 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>