More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0649 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0649  maf protein  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733747  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  47.55 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  47.55 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  47.55 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  47.06 
 
 
191 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  47.06 
 
 
203 aa  161  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  47.55 
 
 
191 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  46.57 
 
 
191 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  45.59 
 
 
191 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  45.59 
 
 
191 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  45.59 
 
 
191 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  45.1 
 
 
200 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05420  MAF protein  44.08 
 
 
212 aa  151  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.417777  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  47.06 
 
 
191 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  45.41 
 
 
205 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  46.91 
 
 
200 aa  147  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  47.18 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  45.54 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  45.27 
 
 
193 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  42.65 
 
 
186 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  45.64 
 
 
194 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  47.29 
 
 
198 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  45.69 
 
 
193 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  46.91 
 
 
197 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  41.24 
 
 
196 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  43.14 
 
 
191 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  44.62 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  45.91 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02160  MAF protein  41.21 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0690685  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  45.91 
 
 
200 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  45.18 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  47.67 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  42.65 
 
 
198 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  45.23 
 
 
198 aa  138  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  45.24 
 
 
200 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  42.86 
 
 
192 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  45.58 
 
 
194 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  46.15 
 
 
197 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  40.49 
 
 
193 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  46.15 
 
 
197 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  45.58 
 
 
194 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  45.45 
 
 
200 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  46.15 
 
 
197 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  45.45 
 
 
200 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0486  Maf-like protein  43.37 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00884241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  45.12 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  45.64 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  44.5 
 
 
205 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  44.62 
 
 
194 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  44 
 
 
213 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  43.78 
 
 
192 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  41.78 
 
 
199 aa  134  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  44.61 
 
 
198 aa  134  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  45.64 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  45.64 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  42.16 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  45.64 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  44.65 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  45.64 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  42.86 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  40.98 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  45.64 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  44.22 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  41.18 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  42.86 
 
 
201 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  41.79 
 
 
199 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  43.46 
 
 
194 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  44.1 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  44.12 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  40.49 
 
 
192 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  41.82 
 
 
197 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  41.82 
 
 
197 aa  131  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  39.22 
 
 
199 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  41.82 
 
 
197 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  44.81 
 
 
195 aa  131  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  41.06 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0172  Maf-like protein  42.52 
 
 
201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  40.49 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  40.58 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  41.67 
 
 
203 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  41.21 
 
 
194 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2898  maf protein  39.23 
 
 
225 aa  129  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  40.1 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  44.9 
 
 
197 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  40 
 
 
194 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  42.56 
 
 
197 aa  127  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03682  Maf-like protein  42.78 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  43.28 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  45.92 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  41.24 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  39.13 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0266  Maf-like protein  44.1 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  39.71 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  45.41 
 
 
197 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  45.41 
 
 
197 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4353  maf protein  40.8 
 
 
212 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000929678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1464  maf protein  37.31 
 
 
190 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  40.98 
 
 
198 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  45.41 
 
 
197 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0586  maf protein  39.69 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>