More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1769 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  100 
 
 
204 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  99.02 
 
 
204 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  91.18 
 
 
204 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  69.27 
 
 
203 aa  201  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  53.73 
 
 
202 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  69.76 
 
 
204 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  55.5 
 
 
202 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  69.35 
 
 
210 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  56 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  52.36 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  52.97 
 
 
202 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  50 
 
 
202 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  53.66 
 
 
212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  50.55 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  51.01 
 
 
199 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  50.26 
 
 
199 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  46.46 
 
 
198 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  52.74 
 
 
202 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  50.56 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  53.59 
 
 
182 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  48.97 
 
 
199 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  52.45 
 
 
205 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  50.26 
 
 
199 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  50.26 
 
 
199 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  43.98 
 
 
196 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  42.27 
 
 
199 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  48.59 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  44.9 
 
 
198 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  42.35 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  48.45 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  39.79 
 
 
195 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  41.97 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  45.3 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  46.19 
 
 
212 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  45.86 
 
 
197 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  38.02 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  35.68 
 
 
200 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  35.18 
 
 
200 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  44.75 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  39.18 
 
 
202 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  38.02 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  38.02 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  38.02 
 
 
194 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  36 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  38.02 
 
 
194 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  36.98 
 
 
187 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  35.9 
 
 
199 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  41.03 
 
 
199 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  38.95 
 
 
197 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  37.5 
 
 
194 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  39.9 
 
 
193 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  39.79 
 
 
197 aa  104  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  36.79 
 
 
198 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  38.07 
 
 
197 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  40.32 
 
 
192 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  38.98 
 
 
198 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  36.41 
 
 
201 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  36.27 
 
 
192 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  34.02 
 
 
193 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1596  maf protein  38.02 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  34.9 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  41.12 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  35.9 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  34.72 
 
 
191 aa  98.2  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1239  maf protein  40.74 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  35.6 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  35.6 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  35.6 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  35.6 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  35.6 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  35.6 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.16 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  30.16 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  38.97 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  33.7 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  34.9 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  35.6 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  35.6 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  30.16 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  30.16 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  30.16 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  41.12 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  30.16 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  35.08 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  37.19 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1557  maf protein  37.04 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000735512  unclonable  0.0000000000405363 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1882  maf protein  37.04 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  41.62 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  37.76 
 
 
213 aa  95.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  31.82 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0482  maf protein  34.39 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0586  maf protein  35.42 
 
 
189 aa  94.7  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  29.63 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  37.24 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  35.11 
 
 
194 aa  94.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3755  maf protein  36.04 
 
 
212 aa  94.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.563863  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  33.33 
 
 
207 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  40.1 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1083  maf protein  33.51 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  32.83 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>