More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0396 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  88.61 
 
 		 202 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  87.56 
 
 		 202 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  76.24 
 
 		 202 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  61.88 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  60.4 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  61.88 
 
 		 182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  53.23 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  52.02 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  53.61 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  48.4 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  52.06 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  52.06 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  48.68 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  54.23 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  52.15 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  52.43 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  49.21 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  50.75 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  40.96 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  44.27 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  43.09 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  48.35 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  46.93 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  42.27 
 
 		 198 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  46.59 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  42.27 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  45.31 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  35.5 
 
 		 200 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  48.24 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  35 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  46.63 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  39.79 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  48.07 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  43.59 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  36.36 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  41.11 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  38.74 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  40.22 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  40.22 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  35.39 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  43.37 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  37.29 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  39.66 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  37.57 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  36.13 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  32.12 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  31.02 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  31.02 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  30.85 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  31.02 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  36.7 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  32.98 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  31.02 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  31.02 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.48 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  31.44 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  29.79 
 
 		 191 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  36.51 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  34.03 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  30.48 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  29.79 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  32.46 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  34.69 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  31.79 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  33.84 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  37.57 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  36.51 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  33.51 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  37.7 
 
 		 191 aa  95.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  33.85 
 
 		 198 aa  94.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  33.16 
 
 		 192 aa  94.4  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  34.76 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  31.96 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  33.68 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  35.75 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  37.91 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  31.96 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  33.87 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  34.03 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  32.65 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  33.51 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  34.55 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1485  Maf-like protein  33.33 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  33.7 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1119  maf protein  33.16 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117235  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  31.58 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  36.02 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  29.02 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0586  maf protein  33.51 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0911  Maf-like protein  36.65 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0752857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  32.24 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  33.67 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  32.12 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  33.51 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  32.4 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  35.98 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  35.23 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  32.4 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  30.85 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>