More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1233 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  97.97 
 
 		 197 aa  351  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  93.4 
 
 		 197 aa  338  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  52.33 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  54.29 
 
 		 198 aa  194  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  50.52 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  47.59 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  44.67 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  44.94 
 
 		 199 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  50.51 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  44.13 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  44.13 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  45.6 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  43.32 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  43.32 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  43.46 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  42.27 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  39.69 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  41.01 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  46.15 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  41.24 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  41.71 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  43.65 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  43.65 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  44.92 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  36.72 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  43.98 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  42.35 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  36.04 
 
 		 195 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  39.66 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  38.29 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  40.51 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  41.54 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  29.95 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  29.95 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  37.36 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  36.75 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  39.11 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  31.96 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  45 
 
 		 203 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  44.07 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  36.16 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.49 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  37.44 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  30.37 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  29.84 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.37 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  29.84 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  32.82 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  32.31 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  32.49 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2269  Maf-like protein  40 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  32.49 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  29.32 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  31.98 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  29.32 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  32.31 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  32.49 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  32.49 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  29.84 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  32.82 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1468  maf protein  33.33 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  32.14 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  29.84 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  27.37 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  32.31 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  33.85 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  26.84 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  36.07 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  31.96 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  31.47 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  31.69 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  30.46 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  36.7 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.017605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  31.47 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  31.47 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  31.47 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  30 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  31.47 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  31.47 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  31.47 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  31.47 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  31.47 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  43.58 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  29.26 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  31.84 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  30.93 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  29.9 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  27.69 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  29.53 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3574  Maf-like protein  30.77 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  32.12 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  28.21 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2532  Maf-like protein  30.77 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1120  septum formation protein MaF  28.57 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.500254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  31.28 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  31.16 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  33.83 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1532  Maf-like protein  28.72 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.2886e-35 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  32.79 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>