More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3451 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  60.71 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  48.98 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  54.29 
 
 		 197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  54.29 
 
 		 197 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  53.14 
 
 		 197 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  47.92 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  45.92 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  46.67 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  43.15 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  46.15 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  43.08 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  46.15 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  46.15 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  42.46 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  41.71 
 
 		 199 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  43.59 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  38.86 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  39.8 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  41.49 
 
 		 202 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  41.33 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  37.85 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  39.66 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  44.27 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  38.29 
 
 		 212 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  42.78 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  40.74 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  36.31 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  38.29 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  36.97 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  41.11 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  40.56 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  44.04 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  37.29 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  38.42 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  37.97 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  36 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  37.85 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  41.01 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  40.68 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  32.64 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.68 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  33.68 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  34.67 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  33.16 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2630  maf protein  33 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000394962  hitchhiker  0.00000875117 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  35.26 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  37.77 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  35.75 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  33.33 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02160  MAF protein  33.5 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0690685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  36.7 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  35.23 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  32.81 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  35.45 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  34.39 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  32.49 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  32.49 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  32.49 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  32.49 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  32.49 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  32.65 
 
 		 194 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  32.49 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  32.49 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  32.49 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  32.65 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  33.86 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  32.65 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  32.49 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  32.64 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  29.69 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  32.65 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  34.69 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  32.07 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  32.65 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  32.12 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  35.6 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2472  maf protein  32.49 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  hitchhiker  0.00610827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0615  maf protein  32.8 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0184201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  31.55 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  31.55 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  31.55 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0586  maf protein  32.11 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  31.55 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  33.7 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  33.5 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  31.02 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  31.19 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  31.19 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  35.2 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  33.51 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  31.19 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.48 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  31.31 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  29.29 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1219  Maf-like protein  33.68 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  30.48 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  37.43 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>