More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2536 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  58.59 
 
 
212 aa  202  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  54.73 
 
 
202 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  54.77 
 
 
202 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  52.08 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  55.28 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  49.74 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  53.96 
 
 
204 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  53.85 
 
 
202 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  52.13 
 
 
199 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  52.13 
 
 
199 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  52.75 
 
 
202 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  48.68 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  46.6 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  49.5 
 
 
199 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  50.55 
 
 
202 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  42.19 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  44.21 
 
 
199 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  41.36 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  43.81 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  50.8 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  47.64 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  50.27 
 
 
204 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  43.15 
 
 
198 aa  140  9e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  41.75 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  48.89 
 
 
182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  46.29 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  51.91 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  47.72 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  47.83 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  39.58 
 
 
196 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  48.48 
 
 
204 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  35.79 
 
 
200 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  35.23 
 
 
200 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  37.43 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  41.71 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  42.49 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  36.79 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  36 
 
 
198 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  39.43 
 
 
197 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  39.43 
 
 
197 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  38.86 
 
 
197 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  37.7 
 
 
200 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  36.55 
 
 
198 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  39.18 
 
 
197 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  39.29 
 
 
199 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  38.19 
 
 
213 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  35.57 
 
 
195 aa  99  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  37.76 
 
 
197 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  36.7 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  35.08 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  34.03 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  33.33 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  38.78 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2292  septum formation protein Maf  30.61 
 
 
200 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.840361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  36.31 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  33.17 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  32.81 
 
 
191 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0706  maf protein  31.79 
 
 
200 aa  92  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.215019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  30.96 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  33.51 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  34.2 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02703  Maf-like protein  38.86 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1221  Maf protein  32.5 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  36.7 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  32.99 
 
 
195 aa  89  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  36.7 
 
 
197 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0468  Maf-like protein  36.26 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1195  Maf-like protein  36.26 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118421  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0401  Maf-like protein  36.26 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  35.98 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0469  Maf-like protein  36.61 
 
 
199 aa  88.2  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  36.17 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  34.02 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0408  Maf-like protein  36.61 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2602  maf protein  38.07 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  35.11 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  35.11 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  35.11 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  35.11 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  36.04 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  35.11 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  35.11 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  35.78 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  39.57 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  35.64 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  34.31 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  29.95 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  32.84 
 
 
200 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  34.69 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.1 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1531  maf protein  35.2 
 
 
190 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  30.1 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  30.1 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  36.84 
 
 
197 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  35.08 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  30.1 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1046  Maf-like protein  37.5 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  36.04 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0976  Maf-like protein  37.5 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>