More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1531 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1531  maf protein  100 
 
 
190 aa  368  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  48.95 
 
 
194 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  45.5 
 
 
203 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  47.67 
 
 
190 aa  121  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  37.97 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  37.97 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  43.24 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  37.97 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  37.97 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  37.97 
 
 
191 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  47.89 
 
 
194 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  37.97 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  43.46 
 
 
191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  47.37 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  41.27 
 
 
193 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  41.08 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  37.43 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  37.43 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  36.9 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  44.39 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  43.16 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  47.67 
 
 
205 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  42.11 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  36.46 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  44.74 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  44.44 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  38.38 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  42.49 
 
 
201 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  39.68 
 
 
191 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  38.02 
 
 
191 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2112  Maf-like protein  35.94 
 
 
192 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  41.4 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  41.4 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  44.21 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  41.4 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  40.21 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  40.86 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0177  maf protein  34.05 
 
 
189 aa  109  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0801823  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  39.38 
 
 
193 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  43.39 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  44.62 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  40.86 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  42.33 
 
 
194 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2348  maf protein  34.17 
 
 
203 aa  107  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000032601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  41.01 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  43.62 
 
 
191 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  41.49 
 
 
192 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  40.31 
 
 
199 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2602  maf protein  43.01 
 
 
195 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  39.15 
 
 
193 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  42.11 
 
 
201 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  38.74 
 
 
192 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0535  maf protein  42.55 
 
 
194 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.997587 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0602  maf protein  34.39 
 
 
184 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  38.46 
 
 
197 aa  104  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  41.58 
 
 
200 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  41.45 
 
 
220 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  45.9 
 
 
198 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  38.22 
 
 
192 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  41.8 
 
 
198 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  41.57 
 
 
192 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  44.79 
 
 
210 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  39.38 
 
 
190 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  40.32 
 
 
197 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  40.21 
 
 
195 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  40.21 
 
 
195 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  38.71 
 
 
186 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  42.93 
 
 
209 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0649  maf protein  36.41 
 
 
220 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733747  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1791  maf protein  38.07 
 
 
213 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1643  maf protein  38.83 
 
 
189 aa  101  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000887737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  41.18 
 
 
202 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  40.21 
 
 
197 aa  101  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  40.11 
 
 
197 aa  101  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  40.21 
 
 
197 aa  101  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  40.64 
 
 
194 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2708  Maf-like protein  41.8 
 
 
193 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.081529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3913  maf protein  46.89 
 
 
199 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.250688  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0976  Maf-like protein  42.33 
 
 
203 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0906  maf protein  41.05 
 
 
199 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  42.71 
 
 
202 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0378  maf protein  41.84 
 
 
202 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  39.3 
 
 
194 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  39.68 
 
 
197 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  37.77 
 
 
199 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  38.5 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  36.36 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  40.93 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  43.92 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  35.26 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0693  maf protein  39.68 
 
 
200 aa  99  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  40.91 
 
 
192 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  40.41 
 
 
199 aa  99  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  45.26 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  32.98 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  40.1 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  39.68 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  39.68 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  39.68 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  39.68 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>